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该研究通过网络药理学和分子对接的方法,对龙葵治疗肝癌的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨.首先,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取龙葵的主要活性成分及其预测靶点.然后,检索OncoDB.hcc和Pharm-DB-K数据库获取肝癌相关的疾病靶点;再将疾病靶点与药物预测靶点进行交集,筛选出共同的肝癌靶点.接着,运用String数据库结合Cytoscape软件绘制肝癌靶点的蛋白相互作用网络(PPI);并运用Cytoscape的ClueGO和CluePedia插件对肝癌靶点进行生物学功能分析和网络构建.最后,通过DISCOVERY STUDIO软件对龙葵的关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证.该研究筛选出龙葵4个活性成分,涉及22个肝癌靶点及相关信号通路7个.网络分析结果表明龙葵可能通过作用于EGFR,TP53,MYC,CCND1,CTNNB1等关键靶点发挥抗肝癌作用.分子对接结果显示槲皮素(quercetin)和EGFR能稳定地结合并通过氨基酸残基LEU718,LYS745,GLN791等发生相互作用.该研究初步揭示了龙葵治疗肝癌具有多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续验证龙葵抗肝癌的分子机制提供了思路.

作者:刘嘉辉;吕东勇;周厚明;邝卫红;陈泽雄;张诗军

来源:中国中药杂志 2020 年 45卷 1期

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作者:
刘嘉辉;吕东勇;周厚明;邝卫红;陈泽雄;张诗军
来源:
中国中药杂志 2020 年 45卷 1期
标签:
网络药理学 肝癌 龙葵 作用机制 分子对接
该研究通过网络药理学和分子对接的方法,对龙葵治疗肝癌的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨.首先,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取龙葵的主要活性成分及其预测靶点.然后,检索OncoDB.hcc和Pharm-DB-K数据库获取肝癌相关的疾病靶点;再将疾病靶点与药物预测靶点进行交集,筛选出共同的肝癌靶点.接着,运用String数据库结合Cytoscape软件绘制肝癌靶点的蛋白相互作用网络(PPI);并运用Cytoscape的ClueGO和CluePedia插件对肝癌靶点进行生物学功能分析和网络构建.最后,通过DISCOVERY STUDIO软件对龙葵的关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证.该研究筛选出龙葵4个活性成分,涉及22个肝癌靶点及相关信号通路7个.网络分析结果表明龙葵可能通过作用于EGFR,TP53,MYC,CCND1,CTNNB1等关键靶点发挥抗肝癌作用.分子对接结果显示槲皮素(quercetin)和EGFR能稳定地结合并通过氨基酸残基LEU718,LYS745,GLN791等发生相互作用.该研究初步揭示了龙葵治疗肝癌具有多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续验证龙葵抗肝癌的分子机制提供了思路.