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目的 本研究旨在通过生物信息学方法分析肝癌中HMGN基因家族的表达水平及其与临床预后的关系.方法 应用TCGA和GEO数据库,分析HMGN家族各成员在肝癌组织与正常组织的表达水平,并进一步分析HMGN家族在肝癌不同分期的表达水平.然后,HMGN基因家族的表达水平与肝癌患者的预后相关性通过GEPIA数据库进行分析.最后,利用LASSO分析,构建肝癌预后风险模型,并评价模型的预测效果.结果 在肝癌组织中,HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平显著高于正常组织.肝癌Ⅰ期的HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平显著低于Ⅱ期和Ⅲ期.HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平与肝癌患者的总体生存率呈负相关.HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平与肝癌患者的无病生存率呈负相关.基于HMGN2、HMGN3和HMGN4的预后风险模型可评估肝细胞癌患者的预后.结论 HMGN1、HMGN2和HMGN4可能成为肝癌新的诊断和治疗靶点.

作者:蔡典葵;李昂;杨思加;韦金星;闵军

来源:岭南现代临床外科 2023 年 23卷 2期

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作者:
蔡典葵;李昂;杨思加;韦金星;闵军
来源:
岭南现代临床外科 2023 年 23卷 2期
标签:
HMGN 肝癌 生物标志物 生物信息学 预后
目的 本研究旨在通过生物信息学方法分析肝癌中HMGN基因家族的表达水平及其与临床预后的关系.方法 应用TCGA和GEO数据库,分析HMGN家族各成员在肝癌组织与正常组织的表达水平,并进一步分析HMGN家族在肝癌不同分期的表达水平.然后,HMGN基因家族的表达水平与肝癌患者的预后相关性通过GEPIA数据库进行分析.最后,利用LASSO分析,构建肝癌预后风险模型,并评价模型的预测效果.结果 在肝癌组织中,HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平显著高于正常组织.肝癌Ⅰ期的HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平显著低于Ⅱ期和Ⅲ期.HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平与肝癌患者的总体生存率呈负相关.HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平与肝癌患者的无病生存率呈负相关.基于HMGN2、HMGN3和HMGN4的预后风险模型可评估肝细胞癌患者的预后.结论 HMGN1、HMGN2和HMGN4可能成为肝癌新的诊断和治疗靶点.