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目的 基于生物信息大数据分析,利用网络药理学分析方法,探讨粉防己碱多靶点、多通路抗肿瘤作用机制.方法 借助于PharmMapper服务器、GeneCards数据库寻找粉防己碱抗肿瘤的潜在靶蛋白,建立潜在网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape进行可视化处理;运用Systems dock Web Site对核心靶点进行分子对接,验证网络分析结果;并借助KOBAS 3.0分析靶点基因生物功能及信号通路.结果 数据分析结果表明,粉防己碱涉及的抗肿瘤作用靶点有86个,主要作用于雌激素受体1(ESR1)、一氧化氮合酶3(NOS3)、过氧化物酶体增殖物激活受体 γ(PPARG)、血清白蛋白(ALB)、糖皮质激素受体(NR3C1)、E3泛素蛋白连接酶(MDM2)、酪氨酸蛋白激酶(LCK)、胰岛素样生长因子(IGF1)等靶蛋白基因,通路富集分析得到与其抗肿瘤作用有关的通路134条,主要涉及肿瘤通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路和代谢通路等信号通路.结论 粉防己碱抗肿瘤作用具有多靶点、多通路特点,为后续开展其抗肿瘤作用机制研究提供了科学依据.

作者:刘伟;张彦忠;白素平;房立真

来源:实用药物与临床 2020 年 23卷 11期

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作者:
刘伟;张彦忠;白素平;房立真
来源:
实用药物与临床 2020 年 23卷 11期
标签:
粉防己碱 网络药理学 抗肿瘤 分子对接 靶点
目的 基于生物信息大数据分析,利用网络药理学分析方法,探讨粉防己碱多靶点、多通路抗肿瘤作用机制.方法 借助于PharmMapper服务器、GeneCards数据库寻找粉防己碱抗肿瘤的潜在靶蛋白,建立潜在网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape进行可视化处理;运用Systems dock Web Site对核心靶点进行分子对接,验证网络分析结果;并借助KOBAS 3.0分析靶点基因生物功能及信号通路.结果 数据分析结果表明,粉防己碱涉及的抗肿瘤作用靶点有86个,主要作用于雌激素受体1(ESR1)、一氧化氮合酶3(NOS3)、过氧化物酶体增殖物激活受体 γ(PPARG)、血清白蛋白(ALB)、糖皮质激素受体(NR3C1)、E3泛素蛋白连接酶(MDM2)、酪氨酸蛋白激酶(LCK)、胰岛素样生长因子(IGF1)等靶蛋白基因,通路富集分析得到与其抗肿瘤作用有关的通路134条,主要涉及肿瘤通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路和代谢通路等信号通路.结论 粉防己碱抗肿瘤作用具有多靶点、多通路特点,为后续开展其抗肿瘤作用机制研究提供了科学依据.