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目的 探讨PAF的治疗靶点及药物,为其临床诊疗提供新的理论和方法.方法 利用GSE2240芯片,选择GPL96基因注释平台采集10例PAF患者和20例窦性心律对照者右心耳芯片数据.应用limma软件包筛选DEGs;应用clusterProfiler软件包进行GO、KEGG富集分析;应用STRING11.0在线数据库进行PPI分析,筛选关键基因;应用CMAP数据库筛选与DEGs负相关的小分子药物.结果 PAF组共筛选出184个DEGs.GO:DEGs参与多种信号通路等生物过程.KEGG:DEGs主要富集于PI3K-Akt信号通路、松弛素信号通路、AGE-RAGE信号通路、细胞外基质与其受体的相互作用、蛋白质的消化与吸收、HIF-1信号通路等.PPI:10个关键基因,其中7个表达上调,3个表达下调.成功筛选到11种与永久性房颤DEGs负相关的小分子药物,其中布美他尼、石蒜碱最有潜力成为治疗PAF的有效药物.结论 NKCC1是PAF潜在的治疗靶点;布美他尼,石蒜碱是潜在治疗PAF的有效药物.

作者:周斌;王艳;赵明明;刘洪云;王英芝;周纪星

来源:山东医学高等专科学校学报 2023 年 45卷 4期

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作者:
周斌;王艳;赵明明;刘洪云;王英芝;周纪星
来源:
山东医学高等专科学校学报 2023 年 45卷 4期
标签:
永久性房颤 基因表达 计算生物学 Permanent atrial fibrillation Gene ex-pression Computational biology
目的 探讨PAF的治疗靶点及药物,为其临床诊疗提供新的理论和方法.方法 利用GSE2240芯片,选择GPL96基因注释平台采集10例PAF患者和20例窦性心律对照者右心耳芯片数据.应用limma软件包筛选DEGs;应用clusterProfiler软件包进行GO、KEGG富集分析;应用STRING11.0在线数据库进行PPI分析,筛选关键基因;应用CMAP数据库筛选与DEGs负相关的小分子药物.结果 PAF组共筛选出184个DEGs.GO:DEGs参与多种信号通路等生物过程.KEGG:DEGs主要富集于PI3K-Akt信号通路、松弛素信号通路、AGE-RAGE信号通路、细胞外基质与其受体的相互作用、蛋白质的消化与吸收、HIF-1信号通路等.PPI:10个关键基因,其中7个表达上调,3个表达下调.成功筛选到11种与永久性房颤DEGs负相关的小分子药物,其中布美他尼、石蒜碱最有潜力成为治疗PAF的有效药物.结论 NKCC1是PAF潜在的治疗靶点;布美他尼,石蒜碱是潜在治疗PAF的有效药物.