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目的 基于胃癌脂质代谢相关基因建立预后风险模型,评价预后风险模型与免疫浸润的关系,为胃癌预后预测提供数据支持.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库中筛选与胃癌预后相关的脂质代谢基因.使用LASSO回归和多因素Cox回归分析构建预后风险模型.使用Kaplan-Meier分析和ROC曲线分析验证预后风险模型的预测效能.xCell分析用于识别高低风险组的免疫状态.构建整合风险模型和临床特征的诺模图.qRT-PCR验证OSBPL1A和MOGAT1 在胃癌组织中的表达水平.结果 筛选得到胃癌脂质代谢相关预后基因OSBPL1A和MOGAT1 并构建预后风险模型,根据风险评分中位数将胃癌患者分为高风险组与低风险组.低风险组患者的总体生存率显著优于高风险组患者(TCGA-STAD 和GSE62254,P均<0.05).时间依赖性ROC分析表明构建的风险模型 1 年、3 年和 5 年总生存率的AUC值分别为 0.65、0.68、0.70 和 0.55、0.60、0.60(TCGA-STAD和GSE62254).xCell分析结果显示与高风险组相比,低风险组的免疫细胞表达量显著增高(P<0.05).整合风险模型和临床特征的诺模图在TCGA-STAD和GSE62254 中的C-index值分别为 0.668 和 0.722,优于其他任何单独指标.与癌旁正常组织相比,OSBPL1A在胃癌组织中表达下调(t=2.348,P<0.05),MOGAT1 在胃癌组织中表达上调(t=2.299,P

作者:徐雪莹;章燕;叶开;钟峰

来源:牡丹江医学院学报 2023 年 44卷 4期

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作者:
徐雪莹;章燕;叶开;钟峰
来源:
牡丹江医学院学报 2023 年 44卷 4期
标签:
胃癌 脂质代谢 免疫浸润 预后预测 gastric cancer lipid metabolism immune infiltration prognosis prediction
目的 基于胃癌脂质代谢相关基因建立预后风险模型,评价预后风险模型与免疫浸润的关系,为胃癌预后预测提供数据支持.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库中筛选与胃癌预后相关的脂质代谢基因.使用LASSO回归和多因素Cox回归分析构建预后风险模型.使用Kaplan-Meier分析和ROC曲线分析验证预后风险模型的预测效能.xCell分析用于识别高低风险组的免疫状态.构建整合风险模型和临床特征的诺模图.qRT-PCR验证OSBPL1A和MOGAT1 在胃癌组织中的表达水平.结果 筛选得到胃癌脂质代谢相关预后基因OSBPL1A和MOGAT1 并构建预后风险模型,根据风险评分中位数将胃癌患者分为高风险组与低风险组.低风险组患者的总体生存率显著优于高风险组患者(TCGA-STAD 和GSE62254,P均<0.05).时间依赖性ROC分析表明构建的风险模型 1 年、3 年和 5 年总生存率的AUC值分别为 0.65、0.68、0.70 和 0.55、0.60、0.60(TCGA-STAD和GSE62254).xCell分析结果显示与高风险组相比,低风险组的免疫细胞表达量显著增高(P<0.05).整合风险模型和临床特征的诺模图在TCGA-STAD和GSE62254 中的C-index值分别为 0.668 和 0.722,优于其他任何单独指标.与癌旁正常组织相比,OSBPL1A在胃癌组织中表达下调(t=2.348,P<0.05),MOGAT1 在胃癌组织中表达上调(t=2.299,P