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目的:基于集成机器学习(machine learning,ML)及增强CT构建透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)免疫影像(immuno-radiomics,ImRad)分型并探讨其对患者预后生存的预测价值.方法:收集癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库113例ccRCC患者的临床、影像及基因表达信息,提取全肿瘤影像组学特征,基于集成ML进行特征筛选并构建免疫浸润、肿瘤突变负荷、免疫耗竭相关基因的ImRad分型.进一步多因素Cox回归分析ImRad对患者总生存(overall survival,OS)的预测效能.结果:经ML构建30个ImRad分型,经五折法验证,基于朴素贝叶斯算法对肿瘤免疫微环境的预测效能最佳(曲线下面积0.717~0.956).与基于临床、病理及ImRad单模态指标对比,融合临床-病理及ImRad的模型预测OS的效能最佳.ImRad特征中,Rad-激活态肥大细胞等8个特征是OS的独立预测因子.结论:基于集成ML及CT组学分析可预测ccRCC免疫微环境并提高预测患者术后生存的效能.

作者:李巧;王宇昊;夏一凡;张玉东

来源:南京医科大学学报(自然科学版) 2023 年 43卷 9期

知识库介绍

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作者:
李巧;王宇昊;夏一凡;张玉东
来源:
南京医科大学学报(自然科学版) 2023 年 43卷 9期
标签:
透明细胞肾细胞癌 CT影像组学 机器学习 免疫浸润 clear cell renal cell carcinoma CT radiomics machine learning immune infiltration
目的:基于集成机器学习(machine learning,ML)及增强CT构建透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)免疫影像(immuno-radiomics,ImRad)分型并探讨其对患者预后生存的预测价值.方法:收集癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库113例ccRCC患者的临床、影像及基因表达信息,提取全肿瘤影像组学特征,基于集成ML进行特征筛选并构建免疫浸润、肿瘤突变负荷、免疫耗竭相关基因的ImRad分型.进一步多因素Cox回归分析ImRad对患者总生存(overall survival,OS)的预测效能.结果:经ML构建30个ImRad分型,经五折法验证,基于朴素贝叶斯算法对肿瘤免疫微环境的预测效能最佳(曲线下面积0.717~0.956).与基于临床、病理及ImRad单模态指标对比,融合临床-病理及ImRad的模型预测OS的效能最佳.ImRad特征中,Rad-激活态肥大细胞等8个特征是OS的独立预测因子.结论:基于集成ML及CT组学分析可预测ccRCC免疫微环境并提高预测患者术后生存的效能.