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目的 通过对日本血吸虫虫卵分泌物(egg secreted products,ESP)的小RNA进行高通量测序,分析、鉴定已知miRNA的表达水平.方法 提取日本血吸虫虫卵ESP miRNA进行高通量测序;通过对数据分析包括统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA的表达水平.结果 将构建文库中日本血吸虫虫卵ESP表达的miRNA与最新miRBase数据库中的miRNA比对,发现在鉴定的12个miRNAs中,sja-miR-3488为表达量最高的miRNA,其次为sja-miR-36-3p和sja-miR-71a,上述三种miRNA表达量占比91.8%.结论 日本血吸虫虫卵ESP三个miRNAs(sja-miR-3488、sja-miR-36-3p和sja-miR-71a)的鉴定为下一步探寻血吸虫病诊疗新靶标奠定了基础.

作者:徐桂娜;何雪梅;周晓蓉;曾凡胜;秦志强

来源:热带病与寄生虫学 2019 年 17卷 4期

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作者:
徐桂娜;何雪梅;周晓蓉;曾凡胜;秦志强
来源:
热带病与寄生虫学 2019 年 17卷 4期
标签:
miRNA 高通量测序 日本血吸虫 虫卵分泌物
目的 通过对日本血吸虫虫卵分泌物(egg secreted products,ESP)的小RNA进行高通量测序,分析、鉴定已知miRNA的表达水平.方法 提取日本血吸虫虫卵ESP miRNA进行高通量测序;通过对数据分析包括统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA的表达水平.结果 将构建文库中日本血吸虫虫卵ESP表达的miRNA与最新miRBase数据库中的miRNA比对,发现在鉴定的12个miRNAs中,sja-miR-3488为表达量最高的miRNA,其次为sja-miR-36-3p和sja-miR-71a,上述三种miRNA表达量占比91.8%.结论 日本血吸虫虫卵ESP三个miRNAs(sja-miR-3488、sja-miR-36-3p和sja-miR-71a)的鉴定为下一步探寻血吸虫病诊疗新靶标奠定了基础.