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目的 获取刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)RH株表面抗原SAG3目的 基因片段,对其结构和功能进行生物信息学分析,预测其编码蛋白作为候选抗原基因的可行性.方法 提取弓形虫的基因组DNA,自行设计一对寡核苷酸引物,PCR体外扩增SAG3基因,用生物信息学方法对SAG3蛋白的理化性质、结构和功能进行预测.结果 扩增出的基因片段约1 174 bp,测序后鉴定其为弓形虫RH株SAG3基因片段.预测SAG3蛋白相对分子质量约为41 785.2,能形成两个功能结构域,氨基酸序列的前38(或39)位为信号肽序列.通过多种预测方法分析SAG3氨基酸序列抗原表位可能位于第10、50、80、95、160、180、220、250、300、330和360位点内或附近.结论 成功获得SAG3基因,为深入研究该基因结构奠定了基础.

作者:杨雯;朱穗京;田春林;王卫群;刘晓泉

来源:热带医学杂志 2009 年 9卷 5期

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作者:
杨雯;朱穗京;田春林;王卫群;刘晓泉
来源:
热带医学杂志 2009 年 9卷 5期
标签:
刚地弓形虫 SAG3基因 体外扩增 生物信息学分析
目的 获取刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)RH株表面抗原SAG3目的 基因片段,对其结构和功能进行生物信息学分析,预测其编码蛋白作为候选抗原基因的可行性.方法 提取弓形虫的基因组DNA,自行设计一对寡核苷酸引物,PCR体外扩增SAG3基因,用生物信息学方法对SAG3蛋白的理化性质、结构和功能进行预测.结果 扩增出的基因片段约1 174 bp,测序后鉴定其为弓形虫RH株SAG3基因片段.预测SAG3蛋白相对分子质量约为41 785.2,能形成两个功能结构域,氨基酸序列的前38(或39)位为信号肽序列.通过多种预测方法分析SAG3氨基酸序列抗原表位可能位于第10、50、80、95、160、180、220、250、300、330和360位点内或附近.结论 成功获得SAG3基因,为深入研究该基因结构奠定了基础.