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目的利用SEREX方法筛选人肝细胞癌(HCC)cDNA表达文库,克隆能引起机体体液免疫应答的抗原编码基因,并对其进行生物信息学分析,以指导对新克隆基因功能的研究.方法采用ZAP-cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning试剂盒构建人HCC cDNA表达文库,用患者自体血清进行筛选,对筛选得到的阳性克隆进行序列测定.通过生物信息学对筛选得到的阳性克隆HCA56进行染色体定位、基因结构分析、蛋白序列预测以及相似性搜索和功能分析.逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)检测HCA56的组织表达谱.结果通过对一个cDNA表达文库的筛选,获得了一个血清反应阳性克隆HCA56,全长2021bp,编码584个氨基酸,定位于染色体1q31~q32.数据库搜寻表明它与人ligatin编码基因片段有95

作者:曲迅;杨美香;孙宝柱;闫实;冯进波

来源:山东医药 2004 年 44卷 1期

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作者:
曲迅;杨美香;孙宝柱;闫实;冯进波
来源:
山东医药 2004 年 44卷 1期
标签:
SEREX HCA56 Ligatin 生物信息学
目的利用SEREX方法筛选人肝细胞癌(HCC)cDNA表达文库,克隆能引起机体体液免疫应答的抗原编码基因,并对其进行生物信息学分析,以指导对新克隆基因功能的研究.方法采用ZAP-cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning试剂盒构建人HCC cDNA表达文库,用患者自体血清进行筛选,对筛选得到的阳性克隆进行序列测定.通过生物信息学对筛选得到的阳性克隆HCA56进行染色体定位、基因结构分析、蛋白序列预测以及相似性搜索和功能分析.逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)检测HCA56的组织表达谱.结果通过对一个cDNA表达文库的筛选,获得了一个血清反应阳性克隆HCA56,全长2021bp,编码584个氨基酸,定位于染色体1q31~q32.数据库搜寻表明它与人ligatin编码基因片段有95