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目的 采用网络药理学和生物信息学的方法研究骨碎补治疗股骨头坏死可能的分子机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台对骨碎补可能的入血活性成分和靶点进行筛选和预测,针对TTD、DrugBank、OMIM、GAD、PharmGKB等数据库对股骨头坏死相关的作用靶点进行挖掘.结合生物信息学方法,使用BisoGenet插件对上述获得的入血活性成分及股骨头坏死相关靶点进行蛋白质-蛋白质相互关系网络绘制,利用Cytoscape软件筛选出骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点.采用Pathway信号通路进行富集分析,以进一步分析其可能的分子机制.结果 在中药系统药理学数据库和分析平台中共检索出与骨碎补相关的入血活性成分72个,根据药物口服生物利用度和药物相似性参数筛选获得入血活性成分18个,利用相关靶点预测技术预测可能的靶点共92个;疾病靶点相关数据库共检索到与股骨头坏死发生、发展密切相关的已知靶点72个.Cytoscape软件筛选出骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点92个;Pathway信号通路富集分析显示,骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点涉及的信号通路主要富集于细胞周期、炎症、癌症相关等35条信号通路.结论 骨碎补治疗股骨头坏死具有多成分、多靶点的特点;其主要通路不仅直接参与骨细胞的增殖、凋亡及分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还通

作者:骆帝;许波;李刚;梁学振;盖帅帅;阎博昭;李嘉程;夏聪敏

来源:山东医药 2018 年 58卷 16期

知识库介绍

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骆帝;许波;李刚;梁学振;盖帅帅;阎博昭;李嘉程;夏聪敏
来源:
山东医药 2018 年 58卷 16期
标签:
股骨头坏死 骨碎补 中药 网络药理学 生物信息学 分子机制 信号通路 osteonecrosis of the femeral head rhizoma drynariae traditional Chinese drugs network pharmacology bioinformatics molecular mechanism signal pathway
目的 采用网络药理学和生物信息学的方法研究骨碎补治疗股骨头坏死可能的分子机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台对骨碎补可能的入血活性成分和靶点进行筛选和预测,针对TTD、DrugBank、OMIM、GAD、PharmGKB等数据库对股骨头坏死相关的作用靶点进行挖掘.结合生物信息学方法,使用BisoGenet插件对上述获得的入血活性成分及股骨头坏死相关靶点进行蛋白质-蛋白质相互关系网络绘制,利用Cytoscape软件筛选出骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点.采用Pathway信号通路进行富集分析,以进一步分析其可能的分子机制.结果 在中药系统药理学数据库和分析平台中共检索出与骨碎补相关的入血活性成分72个,根据药物口服生物利用度和药物相似性参数筛选获得入血活性成分18个,利用相关靶点预测技术预测可能的靶点共92个;疾病靶点相关数据库共检索到与股骨头坏死发生、发展密切相关的已知靶点72个.Cytoscape软件筛选出骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点92个;Pathway信号通路富集分析显示,骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点涉及的信号通路主要富集于细胞周期、炎症、癌症相关等35条信号通路.结论 骨碎补治疗股骨头坏死具有多成分、多靶点的特点;其主要通路不仅直接参与骨细胞的增殖、凋亡及分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还通