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目的 运用网络药理学分析桔梗有效成分、支气管哮喘靶点,并预测桔梗治疗支气管哮喘的作用机制.方法 通过TCMSP数据库获取桔梗的有效成分,通过Pubchem、Swiss target prediction数据库收集桔梗的成分作用靶点,将靶点导入Cytoscape3.6.2软件,制作有效成分与相关作用靶点的关系网络图,得到桔梗中发挥相对重要作用的成分及靶点.通过TTD、Drugbank、DisGeNET、CTD、genecards、OMIM、GAD、KEGG数据库获取支气管哮喘靶点,利用Uniport数据库进行蛋白—基因名标准化.将桔梗靶点与支气管哮喘靶点取交集、去重复,得到桔梗治疗支气管哮喘的预测靶点.将预测靶点导入STRING数据库得到桔梗治疗支气管哮喘靶点的PPI网络,通过Cyto?scape3.6.2软件对PPI网络进行可视化处理.利用Cytoscape3.6.2软件中的Network Analyzer、cytoHubba插件对PPI网络进行核心靶点拓扑,得到桔梗治疗支气管哮喘的核心靶点,利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路分析.结果 共获得符合筛选条件的桔梗有效成分22种(包括刺槐素、木犀草素、桔梗皂苷元等),桔梗成分靶点311个、支气管哮喘靶点1551个.共获得桔梗治疗支气管哮喘的有效靶点137个,其中核心靶点10个,包括半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、分裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、表皮生长因子

作者:莫蕊辰;王娓娓;赵磊;牟林茂

来源:山东医药 2021 年 61卷 5期

知识库介绍

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莫蕊辰;王娓娓;赵磊;牟林茂
来源:
山东医药 2021 年 61卷 5期
标签:
网络药理学 桔梗 支气管哮喘 作用机制 核心靶点
目的 运用网络药理学分析桔梗有效成分、支气管哮喘靶点,并预测桔梗治疗支气管哮喘的作用机制.方法 通过TCMSP数据库获取桔梗的有效成分,通过Pubchem、Swiss target prediction数据库收集桔梗的成分作用靶点,将靶点导入Cytoscape3.6.2软件,制作有效成分与相关作用靶点的关系网络图,得到桔梗中发挥相对重要作用的成分及靶点.通过TTD、Drugbank、DisGeNET、CTD、genecards、OMIM、GAD、KEGG数据库获取支气管哮喘靶点,利用Uniport数据库进行蛋白—基因名标准化.将桔梗靶点与支气管哮喘靶点取交集、去重复,得到桔梗治疗支气管哮喘的预测靶点.将预测靶点导入STRING数据库得到桔梗治疗支气管哮喘靶点的PPI网络,通过Cyto?scape3.6.2软件对PPI网络进行可视化处理.利用Cytoscape3.6.2软件中的Network Analyzer、cytoHubba插件对PPI网络进行核心靶点拓扑,得到桔梗治疗支气管哮喘的核心靶点,利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路分析.结果 共获得符合筛选条件的桔梗有效成分22种(包括刺槐素、木犀草素、桔梗皂苷元等),桔梗成分靶点311个、支气管哮喘靶点1551个.共获得桔梗治疗支气管哮喘的有效靶点137个,其中核心靶点10个,包括半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、分裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、表皮生长因子