您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览139 | 下载80

目的 构建基于细胞毒性T淋巴细胞(CTL)相关基因肝细胞癌(HCC)预后模型,并验证其对HCC患者预后预测的价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)下载HCC患者mRNA基因表达谱数据及对应的临床信息,并使用Lasso-Cox回归构建基于TCGA队列的预后模型,ICGC队列用于外部验证.基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析及单样本基因集富集分析(ssGSEA)免疫细胞浸润及免疫相关功能激活情况.结果 本研究共确定了55个CTL相关的差异表达基因,37个CTL相关的差异表达基因与总生存期相关(P均<0.05),最终构建了包含6个基因的预后模型;受试者工作特征曲线证明了该模型的预测能力;富集分析表明离子通道和免疫相关途径显著富集.结论 成功构建了基于CTL相关基因的肝细胞癌预后模型,并验证了该模型有助于预测HCC患者预后.

作者:叶必成;缪夏晔;刘树青

来源:山东医药 2021 年 61卷 19期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:139 | 下载:80
作者:
叶必成;缪夏晔;刘树青
来源:
山东医药 2021 年 61卷 19期
标签:
肝细胞癌 癌症基因组图谱 国际癌症基因组联盟 细胞毒性T淋巴细胞 预后模型
目的 构建基于细胞毒性T淋巴细胞(CTL)相关基因肝细胞癌(HCC)预后模型,并验证其对HCC患者预后预测的价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)下载HCC患者mRNA基因表达谱数据及对应的临床信息,并使用Lasso-Cox回归构建基于TCGA队列的预后模型,ICGC队列用于外部验证.基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析及单样本基因集富集分析(ssGSEA)免疫细胞浸润及免疫相关功能激活情况.结果 本研究共确定了55个CTL相关的差异表达基因,37个CTL相关的差异表达基因与总生存期相关(P均<0.05),最终构建了包含6个基因的预后模型;受试者工作特征曲线证明了该模型的预测能力;富集分析表明离子通道和免疫相关途径显著富集.结论 成功构建了基于CTL相关基因的肝细胞癌预后模型,并验证了该模型有助于预测HCC患者预后.