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目的 构建基于微小RNA(miRNA,miR)表达量的肺腺癌预后列线图风险模型,研究其对肺腺癌患者生存的预测价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载获取肺腺癌miRNA表达数据,包括miRNAseq和临床数据.应用R 3.6.2软件中的edgeR包筛选肺腺癌组织和正常肺组织的差异基因,以| logFC |>2,P<0.05为筛选条件.应用单因素回归分析、LASSO回归分析、多因素Cox回归分析筛选与预后明显相关的miRNAs,建立风险评分(risk score)方程,构建列线图模型.应用内部验证法和图像校准法、受试者工作特征曲线(ROC)评价模型的特异性和敏感性.通过风险评分及生存曲线对患者进行生存分析.分析miRNAs在各种族表达差异.结果 识别127个差异miRNA,下调16个,上调111个.单因素回归分析得到14个与预后相关的miRNAs,LASSO回归分析得到13个与预后相关的miRNAs(P<0.05).多因素回归分析结果显示hsa-miR-1293、hsa-miR-450a-1、hsa-miR-5571、hsa-miR-3189、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v 是显著的预测因素(P<0.05).应用这8个miRNA构建列线图模型,Concordance值(0.701)及图像校准显示该列线图预测能力较好.1、3、5年曲线下面积(AUC)为0.721、0.748、0.733.生存分析结果显示高风险组较低风险组生存率低(P<0.05),随着风险

作者:眭涛;武朝钦;周炜;余利鹏;黄振飞;常杰;王彤;朱奕;纪婕;王红星;曹晓建;章少华

来源:中华实验外科杂志 2022 年 39卷 12期

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作者:
眭涛;武朝钦;周炜;余利鹏;黄振飞;常杰;王彤;朱奕;纪婕;王红星;曹晓建;章少华
来源:
中华实验外科杂志 2022 年 39卷 12期
标签:
肺腺癌 微小RNA 癌症基因组图谱 预后列线图模型
目的 构建基于微小RNA(miRNA,miR)表达量的肺腺癌预后列线图风险模型,研究其对肺腺癌患者生存的预测价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载获取肺腺癌miRNA表达数据,包括miRNAseq和临床数据.应用R 3.6.2软件中的edgeR包筛选肺腺癌组织和正常肺组织的差异基因,以| logFC |>2,P<0.05为筛选条件.应用单因素回归分析、LASSO回归分析、多因素Cox回归分析筛选与预后明显相关的miRNAs,建立风险评分(risk score)方程,构建列线图模型.应用内部验证法和图像校准法、受试者工作特征曲线(ROC)评价模型的特异性和敏感性.通过风险评分及生存曲线对患者进行生存分析.分析miRNAs在各种族表达差异.结果 识别127个差异miRNA,下调16个,上调111个.单因素回归分析得到14个与预后相关的miRNAs,LASSO回归分析得到13个与预后相关的miRNAs(P<0.05).多因素回归分析结果显示hsa-miR-1293、hsa-miR-450a-1、hsa-miR-5571、hsa-miR-3189、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v 是显著的预测因素(P<0.05).应用这8个miRNA构建列线图模型,Concordance值(0.701)及图像校准显示该列线图预测能力较好.1、3、5年曲线下面积(AUC)为0.721、0.748、0.733.生存分析结果显示高风险组较低风险组生存率低(P<0.05),随着风险