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目的:以网络药理学为载体探索葛根芩连汤治疗腹泻的基因靶点及作用通路.方法:初步检索中药系统药理学数据库与分析平台,查找目标中药的有效成分和基因靶点,定义生物利用度≥30%,类药性≥0.18,确定药物的作用靶点;然后查询OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库,挖掘腹泻疾病的潜在靶点.最后对两种基因取交集,构建中药—成分—靶基因—疾病的中药调控网络,对网络里面的基因构建蛋白互作网络,找到核心基因,进行基因本体和京都基因与基因组百科全书分析.结果:最终确定葛根芩连汤中有效成分总共486个,去除重复后获得有效成分121个,基因靶点221个;腹泻的疾病靶点5217个,二者共同靶点基因182个,PPI网络蛋白分析发现AKT1、CASP3、JUN、PTGS2、RELA、ESR1是葛根芩连汤治疗腹泻的核心靶点.基因本体分析确定了157个条目(P<0.05),其中生物过程主要通过DNA、RNA的转录,细胞因子的结合,蛋白酶的激活及细胞的代谢等过程发挥作用;京都基因与基因组百科全书通路富集分析明确了167条信号通路,其中信号通路涉及炎症、细胞代谢、细胞衰老等方面,主要IL-17信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等.结论:葛根芩连汤对腹泻的治疗主要通过抗炎、缓解肌肉痉挛等机制发挥作用;其具体分子机制尚未得到验证,后期需要借助分子生物学研究,

作者:董永丽;史海霞;王敏;刘全喜

来源:陕西中医 2021 年 42卷 5期

知识库介绍

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董永丽;史海霞;王敏;刘全喜
来源:
陕西中医 2021 年 42卷 5期
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腹泻 葛根芩连汤 网络药理学 作用机制 基因靶点
目的:以网络药理学为载体探索葛根芩连汤治疗腹泻的基因靶点及作用通路.方法:初步检索中药系统药理学数据库与分析平台,查找目标中药的有效成分和基因靶点,定义生物利用度≥30%,类药性≥0.18,确定药物的作用靶点;然后查询OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库,挖掘腹泻疾病的潜在靶点.最后对两种基因取交集,构建中药—成分—靶基因—疾病的中药调控网络,对网络里面的基因构建蛋白互作网络,找到核心基因,进行基因本体和京都基因与基因组百科全书分析.结果:最终确定葛根芩连汤中有效成分总共486个,去除重复后获得有效成分121个,基因靶点221个;腹泻的疾病靶点5217个,二者共同靶点基因182个,PPI网络蛋白分析发现AKT1、CASP3、JUN、PTGS2、RELA、ESR1是葛根芩连汤治疗腹泻的核心靶点.基因本体分析确定了157个条目(P<0.05),其中生物过程主要通过DNA、RNA的转录,细胞因子的结合,蛋白酶的激活及细胞的代谢等过程发挥作用;京都基因与基因组百科全书通路富集分析明确了167条信号通路,其中信号通路涉及炎症、细胞代谢、细胞衰老等方面,主要IL-17信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等.结论:葛根芩连汤对腹泻的治疗主要通过抗炎、缓解肌肉痉挛等机制发挥作用;其具体分子机制尚未得到验证,后期需要借助分子生物学研究,