目的·应用生物信息学方法探讨缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)中差异表达的相关基因,构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络.方法·从基因表达数据库中下载数据集,筛选出ICM样本与正常样本差异表达的mRNA和长链非编码RNA(lncRNA),并进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析.分析差异表达的mRNA和lncRNA,运用生物信息学方法进行miRNA预测分析,构建ceRNA调控网络.结果 ·GO功能分析和KEGG通路分析结果表明,差异表达基因在代谢途径、氧化磷酸化、细胞外基质受体相互作用等通路显著富集,并与内质网应激、纤维化、胶原的分解代谢过程、炎症反应功能密切相关.构建了ICM lncRNA相关的ceRNA调控网络,包含26个mRNA、2个lncRNA和15个miRNA.结论·采用生物信息学方法能够有效分析ICM差异表达的基因,并成功构建了缺血性心肌病ceRNA调控网络.
作者：张鹏；常争艳；杨磊；薛松；连锋
来源：上海交通大学学报（医学版） 2019 年 39卷 7期
