目的·分析人类miR-223-3p(hsa-miR-223-3p)的靶基因及其参与的生物学过程,并寻找与糖尿病相关的生物标志物.方法·利用starBase数据库筛选hsa-miR-223-3p靶基因,并对其行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)和Reactome通路分析.通过构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络获得中枢基因,筛选最有意义的模块,并利用Venn图对糖尿病相关的中枢基因进行分析.结果·共筛选出870个hsa-miR-223-3p靶基因.GO、KEGG和Reactome富集分析显示,靶基因主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子的调节、细胞对胰岛素刺激的反应、RNA结合等相关,且主要富集于胰岛素分泌、泛素介导的蛋白水解、雌激素依赖型基因表达等通路.PPI网络共得31个中枢基因,且中枢基因PRKACB参与胰岛素分泌通路;共筛选出3个最有意义的基因模块,其中模块1参与泛素介导的蛋白水解作用,模块2参与RNA转运和细胞周期,模块3参与内吞作用.结论·Hsa-miR-223-3p可能通过靶基因参与多种生物学过程,中枢基因PRKACB或可为糖尿病发生机制的探索提供帮助.
作者：余梦娜；杨标；仰礼真
来源：上海交通大学学报（医学版） 2020 年 40卷 11期
