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目的 通过蛋白质组学及生物信息学分析等技术手段,探索复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)的发病机制.方法 对RSA组和正常妊娠组的胎盘绒毛组织进行蛋白组学分析,鉴定二者中差异表达的蛋白,同时对这些差异表达的蛋白进行基因相互作用(KEGG)富集分析、信号网络分析(ingenuity pathway analysis,IPA)、蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析等,找出富集通路.通过PPI网站及cytoscape软件,从这些差异蛋白中找出了一些枢纽蛋白,将得分前20的枢纽蛋白和富集最明显KEGG富集通路进行匹配,取它们的交集,从3个通路里分别挑选出对应的3个蛋白,最后用Western印迹法对这3个蛋白进行验证.结果 在两组绒毛组织中总共鉴定出了6438种蛋白质,其中有342个在两组绒毛组织中是差异表达的,共208个上调,134个下调.关于差异表达蛋白的KEGG富集分析显示,上调的蛋白富集最明显的通路为补体和凝血系统,而下调的蛋白富集最明显的通路为核糖体通路,这3个通路对应的枢纽蛋白分别为补体C3、抗凝血酶Ⅲ(AT-Ⅲ)、线粒体核糖体蛋白S7(MRPS7).对这3个蛋白进行的Western印迹法结果显示,MRPS7在RSA组绒毛组织中下调,补体C3、AT-Ⅲ在RSA组中上调,这一结果与蛋白组学检测的结果一致.结论 在RSA胎盘绒毛组织中存在补体系统

作者:骆晓倩;周倩;孟璐璐;帅文;王凯;段涛

来源:同济大学学报(医学版) 2021 年 42卷 2期

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骆晓倩;周倩;孟璐璐;帅文;王凯;段涛
来源:
同济大学学报(医学版) 2021 年 42卷 2期
标签:
生物信息学分析 胎盘绒毛 蛋白组学 复发性流产
目的 通过蛋白质组学及生物信息学分析等技术手段,探索复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)的发病机制.方法 对RSA组和正常妊娠组的胎盘绒毛组织进行蛋白组学分析,鉴定二者中差异表达的蛋白,同时对这些差异表达的蛋白进行基因相互作用(KEGG)富集分析、信号网络分析(ingenuity pathway analysis,IPA)、蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析等,找出富集通路.通过PPI网站及cytoscape软件,从这些差异蛋白中找出了一些枢纽蛋白,将得分前20的枢纽蛋白和富集最明显KEGG富集通路进行匹配,取它们的交集,从3个通路里分别挑选出对应的3个蛋白,最后用Western印迹法对这3个蛋白进行验证.结果 在两组绒毛组织中总共鉴定出了6438种蛋白质,其中有342个在两组绒毛组织中是差异表达的,共208个上调,134个下调.关于差异表达蛋白的KEGG富集分析显示,上调的蛋白富集最明显的通路为补体和凝血系统,而下调的蛋白富集最明显的通路为核糖体通路,这3个通路对应的枢纽蛋白分别为补体C3、抗凝血酶Ⅲ(AT-Ⅲ)、线粒体核糖体蛋白S7(MRPS7).对这3个蛋白进行的Western印迹法结果显示,MRPS7在RSA组绒毛组织中下调,补体C3、AT-Ⅲ在RSA组中上调,这一结果与蛋白组学检测的结果一致.结论 在RSA胎盘绒毛组织中存在补体系统