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目的:运用网络药理学方法探究枸杞子干预视网膜色素变性(RP)可能的作用机制.方法:检索国家知识基础设施数据库、中国学术期刊数据库、中文科技期刊数据库上正式公开发表的有关中药方剂治疗RP临床疗效的文献,记录其方剂中使用的中药名称及使用频数.运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出枸杞子口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的化合物作为候选药效成分,根据TCMSP的"Related Targets"对枸杞子的活性成分的作用靶点进行预测,采用Cytoscape3.6.0软件构建化合物-靶点网络.通过DrugBank、DisGeNET数据库查找RP相关基因,通过STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析.通过韦恩图将枸杞子活性成分靶点与RP疾病靶点取交集,得到枸杞子有效活性成分治疗RP的关键靶点.使用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能注释和KEGG信号通路富集.结果:筛选出了62个中药方剂,共记录中药97种.其中使用频率最高的中药为枸杞子,共42次.得到枸杞子有对应靶点的活性成分29个,预测作用靶点188个,RP相关基因244个,枸杞子治疗RP的关键靶点12个,靶点参与的功能主要有基因表达的调控、细胞增殖、RNA转录调控、血管生成、缺氧等,主要的作用通路为PI3K-AKT信号通路、神经营养因子信号通路.结论:枸杞子可能通过PI3 K-AKT信号

作者:欧晨;宋厚盼;杨毅敬;周亚莎;彭清华

来源:世界中医药 2021 年 16卷 8期

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欧晨;宋厚盼;杨毅敬;周亚莎;彭清华
来源:
世界中医药 2021 年 16卷 8期
标签:
枸杞子 视网膜色素变性 网络药理学 作用机制 中药 靶点 基因 信号通路
目的:运用网络药理学方法探究枸杞子干预视网膜色素变性(RP)可能的作用机制.方法:检索国家知识基础设施数据库、中国学术期刊数据库、中文科技期刊数据库上正式公开发表的有关中药方剂治疗RP临床疗效的文献,记录其方剂中使用的中药名称及使用频数.运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出枸杞子口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的化合物作为候选药效成分,根据TCMSP的"Related Targets"对枸杞子的活性成分的作用靶点进行预测,采用Cytoscape3.6.0软件构建化合物-靶点网络.通过DrugBank、DisGeNET数据库查找RP相关基因,通过STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析.通过韦恩图将枸杞子活性成分靶点与RP疾病靶点取交集,得到枸杞子有效活性成分治疗RP的关键靶点.使用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能注释和KEGG信号通路富集.结果:筛选出了62个中药方剂,共记录中药97种.其中使用频率最高的中药为枸杞子,共42次.得到枸杞子有对应靶点的活性成分29个,预测作用靶点188个,RP相关基因244个,枸杞子治疗RP的关键靶点12个,靶点参与的功能主要有基因表达的调控、细胞增殖、RNA转录调控、血管生成、缺氧等,主要的作用通路为PI3K-AKT信号通路、神经营养因子信号通路.结论:枸杞子可能通过PI3 K-AKT信号