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目的:探讨缓衰方对慢性肾脏病(CKD)心肾保护作用的机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TC-MSP)检索缓衰方中5味中药的有效活性成分并获得相应的预测靶点;通过GEO数据库、GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索与CKD和心血管疾病(CVD)相关的靶点,并对药物靶点和疾病靶点进行映射取交集作为缓衰方对CKD患者心肾保护作用的关键靶点.基于String数据库对关键靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,并通过拓扑分析得到缓衰方对CKD患者心肾保护作用的核心靶点,基于autodock软件对缓衰方的活性成分和核心靶点作分子对接,分析成分和靶点的结合能力.并对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:共得到缓衰方有效活性成分105种,预测靶点135个,得到CKD疾病相关靶点1436个,CVD疾病相关靶点744个.共得到缓衰方对CKD心肾保护作用的关键靶点53个,拓扑分析得到核心靶点18个,分子对接结果显示缓衰方的11个活性成分和10个核心靶点平均最低结合能为-6.58 kcal/mol,其中豆甾醇、槲皮素与PTGS2靶点蛋白结合能最高.共得到对氧含量的反应、细胞对药物的反应、循环系统中的血管过程等1275个GO富集结果和低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF

作者:刘童童;王宇阳;王倩;冒慧敏;占永立

来源:世界中医药 2021 年 16卷 20期

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作者:
刘童童;王宇阳;王倩;冒慧敏;占永立
来源:
世界中医药 2021 年 16卷 20期
标签:
网络药理学;缓衰方;慢性肾脏病;心血管疾病;活性成分;靶点;信号通路;作用机制
目的:探讨缓衰方对慢性肾脏病(CKD)心肾保护作用的机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TC-MSP)检索缓衰方中5味中药的有效活性成分并获得相应的预测靶点;通过GEO数据库、GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索与CKD和心血管疾病(CVD)相关的靶点,并对药物靶点和疾病靶点进行映射取交集作为缓衰方对CKD患者心肾保护作用的关键靶点.基于String数据库对关键靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,并通过拓扑分析得到缓衰方对CKD患者心肾保护作用的核心靶点,基于autodock软件对缓衰方的活性成分和核心靶点作分子对接,分析成分和靶点的结合能力.并对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:共得到缓衰方有效活性成分105种,预测靶点135个,得到CKD疾病相关靶点1436个,CVD疾病相关靶点744个.共得到缓衰方对CKD心肾保护作用的关键靶点53个,拓扑分析得到核心靶点18个,分子对接结果显示缓衰方的11个活性成分和10个核心靶点平均最低结合能为-6.58 kcal/mol,其中豆甾醇、槲皮素与PTGS2靶点蛋白结合能最高.共得到对氧含量的反应、细胞对药物的反应、循环系统中的血管过程等1275个GO富集结果和低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF