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为探求罗氏沼虾精氨酸激酶(Macrobrechium rosenbergii arginine kinase,MrAK)基因特征和与病毒感染的相关性,研究通过4K基因mRNA全长克隆,并采用QPCR检测病毒感染前后不同时间点罗氏沼虾幼体AK基因的转录差异.最终克隆得到的AK序列全长为1740 bp (GenBank:KT970484),其开放阅读框包含1068个碱基,编码356个氨基酸;同源性分析显示MrAK基因编码区蛋白与多齿新米虾、南极磷虾、鲑鱼海虱和安氏伪镖水蚤的同源性分别为97%、82%、83%和79%;系统进化树分析表明,该基因与多齿新米虾的AK聚在同一分支簇,而蟹、对虾和螯虾聚在另一分支;氨基酸结构分析表明,其存在一个可能的ATP:胍基磷酸转移酶的活性位点(Cys286-Pr0287-Thr288-Asn289-Leu290-Glv291-Thr292);病毒感染罗氏沼虾幼体后,其AK基因表达在第9h开始出现显著性上调,在12h时达到峰值,随后开始降低.以上研究结果表明,AK基因在无脊椎甲壳动物中存在多样性,其蛋白结构存在保守性,并且其在罗氏沼虾病毒感染过程中起到潜在的能量供给调节作用.

作者:田荣;许婷;潘晓艺;沈锦玉

来源:水生生物学报 2016 年 40卷 5期

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田荣;许婷;潘晓艺;沈锦玉
来源:
水生生物学报 2016 年 40卷 5期
标签:
罗氏沼虾 双顺反子病毒 精氨酸激酶 mRNA表达 Macrobrachium rosenbergii Dicistrovirus Arginine kinase mRNA expression
为探求罗氏沼虾精氨酸激酶(Macrobrechium rosenbergii arginine kinase,MrAK)基因特征和与病毒感染的相关性,研究通过4K基因mRNA全长克隆,并采用QPCR检测病毒感染前后不同时间点罗氏沼虾幼体AK基因的转录差异.最终克隆得到的AK序列全长为1740 bp (GenBank:KT970484),其开放阅读框包含1068个碱基,编码356个氨基酸;同源性分析显示MrAK基因编码区蛋白与多齿新米虾、南极磷虾、鲑鱼海虱和安氏伪镖水蚤的同源性分别为97%、82%、83%和79%;系统进化树分析表明,该基因与多齿新米虾的AK聚在同一分支簇,而蟹、对虾和螯虾聚在另一分支;氨基酸结构分析表明,其存在一个可能的ATP:胍基磷酸转移酶的活性位点(Cys286-Pr0287-Thr288-Asn289-Leu290-Glv291-Thr292);病毒感染罗氏沼虾幼体后,其AK基因表达在第9h开始出现显著性上调,在12h时达到峰值,随后开始降低.以上研究结果表明,AK基因在无脊椎甲壳动物中存在多样性,其蛋白结构存在保守性,并且其在罗氏沼虾病毒感染过程中起到潜在的能量供给调节作用.