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为研究拟穴青蟹(Scylla paramamosain)不同形态群体对温度变化的适应差异,以Sp1群体(腕节外缘中部都不具有发达的刺)和Sp2群体(至少一只螯足腕节外缘中部具有发达的刺)为研究对象,选用低温胁迫组(8℃)和对照组(20℃)拟穴青蟹肝胰腺为实验材料,进行转录组测序.结果显示,测序共获得81853个Unigene,平均长度为420 bp,N50为1460 bp,其中22.33%为已知基因.差异表达基因筛选发现Sp1群体在低温胁迫下共有15773个Unigene显著差异表达,其中15628个Unigene表达下调,145个Unigene表达上调,这些Unigene显著富集于细胞质基质等生物学过程和RNA结合、核糖体结构组分等分子功能,并进一步富集在核糖体、剪接体和内质网蛋白质加工等信号通路.Sp2群体在低温胁迫下共有323个Unigene显著差异表达,其中上调114个,下调209个.这些Unigene显著富集于DNA整合等生物学过程和甾体羟化酶活性、碳酸氢盐跨膜转运体活性等分子功能,并进一步富集在赖氨酸降解、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢、精氨酸和脯氨酸的代谢等代谢通路.以上结果表明,水温从20℃骤降至8℃,Sp1群体大量基因表达下调,生理活动大幅度降低,这可能与寒冷的冬季青蟹停止摄食、穴居不动等行为相对应;而Sp2群体仅调整了物质代谢,表明Sp2群体可能对温度骤降的响应较为迟缓.

作者:陈洁;董梦;崔悦;房翠莲;陈旭堂;刘子明

来源:水生生物学报 2022 年 46卷 8期

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作者:
陈洁;董梦;崔悦;房翠莲;陈旭堂;刘子明
来源:
水生生物学报 2022 年 46卷 8期
标签:
低温胁迫 形态群体 转录组分析 拟穴青蟹
为研究拟穴青蟹(Scylla paramamosain)不同形态群体对温度变化的适应差异,以Sp1群体(腕节外缘中部都不具有发达的刺)和Sp2群体(至少一只螯足腕节外缘中部具有发达的刺)为研究对象,选用低温胁迫组(8℃)和对照组(20℃)拟穴青蟹肝胰腺为实验材料,进行转录组测序.结果显示,测序共获得81853个Unigene,平均长度为420 bp,N50为1460 bp,其中22.33%为已知基因.差异表达基因筛选发现Sp1群体在低温胁迫下共有15773个Unigene显著差异表达,其中15628个Unigene表达下调,145个Unigene表达上调,这些Unigene显著富集于细胞质基质等生物学过程和RNA结合、核糖体结构组分等分子功能,并进一步富集在核糖体、剪接体和内质网蛋白质加工等信号通路.Sp2群体在低温胁迫下共有323个Unigene显著差异表达,其中上调114个,下调209个.这些Unigene显著富集于DNA整合等生物学过程和甾体羟化酶活性、碳酸氢盐跨膜转运体活性等分子功能,并进一步富集在赖氨酸降解、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢、精氨酸和脯氨酸的代谢等代谢通路.以上结果表明,水温从20℃骤降至8℃,Sp1群体大量基因表达下调,生理活动大幅度降低,这可能与寒冷的冬季青蟹停止摄食、穴居不动等行为相对应;而Sp2群体仅调整了物质代谢,表明Sp2群体可能对温度骤降的响应较为迟缓.