采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、莫愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16S rDNA的PCR扩增结果约为 626 bp,为 16S rDNA V3~V5 区特异性片段.玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20 种优势菌群,且同一湖泊不同采样点DGGE 图谱的差异性不大,细菌群落结构具有较高的相似性,而太湖样品DGGE 条带的数目和位置表现出明显差异,且不同采样点图谱的差异性较大.三湖泊除具有特征性的微生物种属外,还分布约5个相同的细菌种群,可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关.对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序,结果显示其优势菌群具有不同的序列组成,其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99
作者:赵兴青;杨柳燕;陈灿;肖琳;蒋丽娟;马喆;朱昊巍;于振洋;尹大强
来源:生态学报 2006 年 26卷 11期