目的:利用生物信息学方法,将高通量基因表达数据与单核酸多肽(SNP)基因型数据进行整合分析,研究并注释前列腺癌风险基因.方法:本文基于EST、SAGE、基因芯片三类功能基因组数据整合的方法研究前列腺癌风险基因.首先,通过三类数据寻找前列腺癌中异常表达和差异表达基因.利用全基因组关联分析得到前列腺癌相关基因的SNPs.定位所得到的前例腺癌差异表达基因与SNPs到染色体,获取与SNPs在同一区段的差异表达基因,并通过各种数据库注释所得基因.结果:通过数据整合分析,最终得到前列腺癌风险基因84个,其中20多个基因已被证实与前列腺癌极其相关.结论:整合前列腺癌高通量表达数据与SNP基因型数据,能够快速有效的获得前列腺癌显著相关基因.此方法可以推广于其它癌症的研究.
作者：马晔；田进伟；孙红梅；徐良德
来源：现代生物医学进展 2012 年 12卷 31期
