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根据苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,采用RT-PCR技术和PCR技术克隆得到一个C2C2型锌指蛋白基因FtLOL1(FtLSD-one-like1,GenBank登录号:KP260662),获得cDNA和DNA全长序列,采用实时荧光定量PCR技术研究FtLOL1在3种非生物处理条件下的表达模式.结果显示,苦荞FtLOL1基因DNA全长1 720bp,由5个外显子和4个内含子组成,符合GT-AG剪切原则;cDNA包含一个444 bp的开放阅读框,编码147个氨基酸,具有LSD1家族的典型特征;2mmol/L水杨酸、UV-B照射和4℃冷处理均能导致FtLOL1基因表达量下降,其中水杨酸和UV-B处理均在12h达到最小值,分别为对照组(0h)的11.9%和33.8%,而4℃冷处理条件下,FtLOL1表达量12h开始下降,至24h达到最小值,为对照组(0h)的50.7%,36h后表达量有所回升,稳定在对照组(0h)的60%左右.推测该基因可能参与苦荞抗高浓度水杨酸、UV-B照射和冷胁迫等非生物胁迫的应答反应,为探究苦荞抗逆性提供了新的视角.

作者:高飞;周婧;刘晓彤;李成磊;姚慧鹏;赵海霞;吴琦

来源:中国生物工程杂志 2015 年 35卷 8期

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高飞;周婧;刘晓彤;李成磊;姚慧鹏;赵海霞;吴琦
来源:
中国生物工程杂志 2015 年 35卷 8期
标签:
苦荞 锌指蛋白 基因克隆 非生物胁迫 表达 Fagopyrum tataricum Zinc finger protein LSD1 Gene cloning Abiotic stress Gene expression
根据苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,采用RT-PCR技术和PCR技术克隆得到一个C2C2型锌指蛋白基因FtLOL1(FtLSD-one-like1,GenBank登录号:KP260662),获得cDNA和DNA全长序列,采用实时荧光定量PCR技术研究FtLOL1在3种非生物处理条件下的表达模式.结果显示,苦荞FtLOL1基因DNA全长1 720bp,由5个外显子和4个内含子组成,符合GT-AG剪切原则;cDNA包含一个444 bp的开放阅读框,编码147个氨基酸,具有LSD1家族的典型特征;2mmol/L水杨酸、UV-B照射和4℃冷处理均能导致FtLOL1基因表达量下降,其中水杨酸和UV-B处理均在12h达到最小值,分别为对照组(0h)的11.9%和33.8%,而4℃冷处理条件下,FtLOL1表达量12h开始下降,至24h达到最小值,为对照组(0h)的50.7%,36h后表达量有所回升,稳定在对照组(0h)的60%左右.推测该基因可能参与苦荞抗高浓度水杨酸、UV-B照射和冷胁迫等非生物胁迫的应答反应,为探究苦荞抗逆性提供了新的视角.