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苹果酸脱氢酶具有氧化还原活性,主要控制动物机体的能量代谢.旨在克隆牦牛MDHI基因,结合生物信息学和组织表达分析,为研究牦牛MDHI基因的理化性质及功能奠定基础.结果显示,该基因的cDNA序列长1169 bp,CDS区全长1005 bp,编码334个氨基酸,编码的蛋白为亲水性稳定蛋白;属于保守结构域家族;有两个跨膜区,分别是6-22位和34-54位;存在26个磷酸化位点,其中有11个Ser磷酸化位点、11个Thr磷酸化位点、4个Tyr磷酸化位点;二级结构主要由 α-螺旋(152个,占45.51%),无规卷曲(110个,占32.93%)组成;三级结构与猪细胞质苹果酸脱氢酶、α-酮丙二酸和四氢NAD的三元复合物的晶体结构具有98.50% 的相似性;亚细胞定位分析得到在内质网中分布最多,在高尔基体和细胞核中分布最少;同源性及系统进化树分析表明牦牛该基因与普通牛的同源性最高,推测牦牛MDHI基因在进化水平上较为保守;组织表达分析表明该基因在臀脂中表达量最高,在臀肌中表达量较低,说明该基因参与机体脂肪沉积的调控.成功克隆了MDHI基因CDS区、并进行了生物信息学及组织表达分析.

作者:陈露露;王会;柴志欣;钟金城;王吉坤;陈智华;姬秋梅;信金伟

来源:生物技术通报 2019 年 35卷 2期

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作者:
陈露露;王会;柴志欣;钟金城;王吉坤;陈智华;姬秋梅;信金伟
来源:
生物技术通报 2019 年 35卷 2期
标签:
牦牛 MDHI基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
苹果酸脱氢酶具有氧化还原活性,主要控制动物机体的能量代谢.旨在克隆牦牛MDHI基因,结合生物信息学和组织表达分析,为研究牦牛MDHI基因的理化性质及功能奠定基础.结果显示,该基因的cDNA序列长1169 bp,CDS区全长1005 bp,编码334个氨基酸,编码的蛋白为亲水性稳定蛋白;属于保守结构域家族;有两个跨膜区,分别是6-22位和34-54位;存在26个磷酸化位点,其中有11个Ser磷酸化位点、11个Thr磷酸化位点、4个Tyr磷酸化位点;二级结构主要由 α-螺旋(152个,占45.51%),无规卷曲(110个,占32.93%)组成;三级结构与猪细胞质苹果酸脱氢酶、α-酮丙二酸和四氢NAD的三元复合物的晶体结构具有98.50% 的相似性;亚细胞定位分析得到在内质网中分布最多,在高尔基体和细胞核中分布最少;同源性及系统进化树分析表明牦牛该基因与普通牛的同源性最高,推测牦牛MDHI基因在进化水平上较为保守;组织表达分析表明该基因在臀脂中表达量最高,在臀肌中表达量较低,说明该基因参与机体脂肪沉积的调控.成功克隆了MDHI基因CDS区、并进行了生物信息学及组织表达分析.