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目的 检测昆明地区麻疹病毒的优势基因型,为麻疹监测和防治提供依据.方法 采集2008年昆明地区临床诊断为麻疹的30例患儿,其中男性18例,女性12例;年龄51天~3岁,0~1岁(≤1岁)的患儿19例,1~2岁(≤2岁)的患儿9例,2~3岁(≤3岁)的患儿2例,平均患病年龄15个月.采集急性传染期静脉血2mL,应用酶联免疫吸附分析(ELISA)检测麻疹病毒血清IgM抗体;同时收集患儿的尿液标本,运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中所分离到的麻疹野病毒株核蛋白(N)基因羧基末端的543个核苷酸,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并与麻疹病毒基因库中的参考株进行比较.结果 从30份麻疹患儿尿液标本中分离到7份麻疹野病毒阳性;出疹后6d的尿液标本中仍可检出麻疹野病毒;将其4株麻疹野病毒的核蛋白(N)羧基末端的543个核苷酸与Genebank中的麻疹病毒的23个参考株进行基因亲缘性关系比较,与世界卫生组织(WHO)的H1、H2基因型参考株China 93-7、China 94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.031~0.047和0.332~0.398;而与H1a的遗传距离最近,为0.010~ 0.033;4株麻疹野病毒N基因羧基末端543个核苷酸的同源性为96.0%~98.9%;与H1标准株China 93-7和H1a标准株China 93-2的核苷酸同源性分别为95.9%~99.7%和96.9%~99.8%.结论 20

作者:尚晓丽;夏晓玲;侯宗柳;杜曾庆

来源:生物医学工程与临床 2012 年 16卷 2期

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作者:
尚晓丽;夏晓玲;侯宗柳;杜曾庆
来源:
生物医学工程与临床 2012 年 16卷 2期
标签:
麻疹病毒 基因型 昆明 序列分析 野病毒株
目的 检测昆明地区麻疹病毒的优势基因型,为麻疹监测和防治提供依据.方法 采集2008年昆明地区临床诊断为麻疹的30例患儿,其中男性18例,女性12例;年龄51天~3岁,0~1岁(≤1岁)的患儿19例,1~2岁(≤2岁)的患儿9例,2~3岁(≤3岁)的患儿2例,平均患病年龄15个月.采集急性传染期静脉血2mL,应用酶联免疫吸附分析(ELISA)检测麻疹病毒血清IgM抗体;同时收集患儿的尿液标本,运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中所分离到的麻疹野病毒株核蛋白(N)基因羧基末端的543个核苷酸,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并与麻疹病毒基因库中的参考株进行比较.结果 从30份麻疹患儿尿液标本中分离到7份麻疹野病毒阳性;出疹后6d的尿液标本中仍可检出麻疹野病毒;将其4株麻疹野病毒的核蛋白(N)羧基末端的543个核苷酸与Genebank中的麻疹病毒的23个参考株进行基因亲缘性关系比较,与世界卫生组织(WHO)的H1、H2基因型参考株China 93-7、China 94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.031~0.047和0.332~0.398;而与H1a的遗传距离最近,为0.010~ 0.033;4株麻疹野病毒N基因羧基末端543个核苷酸的同源性为96.0%~98.9%;与H1标准株China 93-7和H1a标准株China 93-2的核苷酸同源性分别为95.9%~99.7%和96.9%~99.8%.结论 20