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目的:探讨 lncRNA - AK058003在缺氧诱导胃癌侵袭和转移中的作用。方法:SGC7901、MKN45、MKN28三个胃癌细胞系,分别经常氧/缺氧孵育24h 后,Trizol 法提取3例配对的胃癌细胞总 RNA,利用高通量 lncRNA 芯片比较它们之间的表达谱差异。通过差异倍数、邻近编码基因信息分析、长度特征分析等策略初步筛选与缺氧诱导胃癌侵袭转移相关的关键分子。RT - PCR 法检测 lncRNA - AK058003在缺氧诱导的胃癌细胞中相对于常氧条件下的表达水平,进一步检测其在20例胃癌临床标本中相对于癌旁组织的表达水平。构建小干扰 RNA 慢病毒,稳定下调 AK058003在 SGC7901及 MKN45中的表达。Transwell、划痕实验、裸鼠尾静脉注入不同胃癌细胞等体外和体内实验检测抑制 AK058003后对常氧和缺氧条件下胃癌侵袭转移的影响。结果:高通量 lncRNA 芯片比较发现:缺氧诱导的胃癌细胞 SGC7901、MKN45和 MKN28与常氧条件下的细胞相比,有84个分子的表达在缺氧诱导的胃癌细胞中显著上调(P <0.05),其中差异倍数在3倍以上的共有5个。多重筛选策略提示 AK058003可能是缺氧诱导胃癌侵袭转移的关键 lncRNA 分子之一。RT - PCR 结果显示:AK058003在缺氧诱导的胃癌细胞中显著上调,其分别在 SGC7901缺氧16h,MKN45缺氧24h,MKN28缺氧48h

作者:黄晓峰;王亚芳;刘理礼

来源:现代肿瘤医学 2016 年 2期

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作者:
黄晓峰;王亚芳;刘理礼
来源:
现代肿瘤医学 2016 年 2期
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长链非编码RNA - AK058003 转移 胃癌 缺氧 long non - coding RNA AK058003 metastasis gastric cancer hypoxia
目的:探讨 lncRNA - AK058003在缺氧诱导胃癌侵袭和转移中的作用。方法:SGC7901、MKN45、MKN28三个胃癌细胞系,分别经常氧/缺氧孵育24h 后,Trizol 法提取3例配对的胃癌细胞总 RNA,利用高通量 lncRNA 芯片比较它们之间的表达谱差异。通过差异倍数、邻近编码基因信息分析、长度特征分析等策略初步筛选与缺氧诱导胃癌侵袭转移相关的关键分子。RT - PCR 法检测 lncRNA - AK058003在缺氧诱导的胃癌细胞中相对于常氧条件下的表达水平,进一步检测其在20例胃癌临床标本中相对于癌旁组织的表达水平。构建小干扰 RNA 慢病毒,稳定下调 AK058003在 SGC7901及 MKN45中的表达。Transwell、划痕实验、裸鼠尾静脉注入不同胃癌细胞等体外和体内实验检测抑制 AK058003后对常氧和缺氧条件下胃癌侵袭转移的影响。结果:高通量 lncRNA 芯片比较发现:缺氧诱导的胃癌细胞 SGC7901、MKN45和 MKN28与常氧条件下的细胞相比,有84个分子的表达在缺氧诱导的胃癌细胞中显著上调(P <0.05),其中差异倍数在3倍以上的共有5个。多重筛选策略提示 AK058003可能是缺氧诱导胃癌侵袭转移的关键 lncRNA 分子之一。RT - PCR 结果显示:AK058003在缺氧诱导的胃癌细胞中显著上调,其分别在 SGC7901缺氧16h,MKN45缺氧24h,MKN28缺氧48h