背景 神经重症医学科(NICU)患者常存在意识及肢体运动障碍,多存在侵入性操作,免疫功能降低,因此其是肺炎克雷伯菌(KP)高危感染人群.探索非多重耐药KP的致病毒力、传播特点对指导临床治疗、减少多重耐药菌转化至关重要.目的 通过全基因组测序分析,了解NICU感染患者非多重耐药KP毒力基因分布与传播特征.方法 收集2015—2018年开滦总医院收治的93例NICU感染患者的非多重耐药KP 94株,所有KP应用K-B法进行抗菌药物敏感试验及脉冲场凝胶电泳法(PFGE)进行同源性分析,选出其中无同源性的KP 3株,其中2015年、2016年、2017年各1株,分别编号为P20、P39、P66;2018年,选出与P66为同一流行克隆系的KP 2株,分别编号为P90、P91,且P90与P91为同一克隆株.将5株非多重耐药KP进行二代、三代全基因组测序,将所得的基因组测序结果上传至NCBI的prokaryotic annotation pipeline系统进行基因组预测基因注释,并应用BLAST软件进行对比分析,获取病原菌毒力因子数据库(VFDB)比对基因注释结果.结果 将NICU感染患者5株非多重耐药KP的基因组测序结果与VFDB进行比对,结果显示,5株非多重耐药KP中共筛选出6大类52种毒力基因,包括黏附类17种(32.7%)、分泌系统类15种(28.8%)、铁吸收类15种(28.8%)、调节类3种(5.8%)、内毒素类1种(1.9%)、
作者:元小冬;张萍淑;刘妍;李妍;耿贺梅;王贺永;张淑清;刘青
来源:实用心脑肺血管病杂志 2021 年 29卷 8期