目的 探讨不同病理类型食管癌患者的食管菌群特征.方法 37例食管癌患者依据手术组织病理分为鳞癌组29例和非鳞癌(腺癌和神经内分泌癌)组8例,对细菌16 SrRNA基因序列V4高变区扩增,用Illumina HiSeq测序,可操作分类单元聚类分析2组菌群结构、丰度和多样性.结果 非鳞癌组Chao1指数(514.790±257.529)、Shannon指数(5.929±1.015)和Simpson指数(0.950±0.027)与鳞癌组(532.636±251.516、5.661±0.962、0.934±0.051)比较差异均无统计学意义(P>0.05),2组菌群丰度相似;非度量多维尺度分析显示2组样本分布有交叉,不能完全区分,2组菌群多样性无明显差异.在门水平,非鳞癌组放线菌门、绿菌门、脱铁杆菌门、梭杆菌门丰度较鳞癌组增多(P<0.05),其余菌门2组比较差异无统计学意义(P>0.05).差异显著的29个属中,鳞癌组短杆菌属、弗兰克氏菌属、纤维菌属、桥杆菌属、香味菌属、糖杆菌属、芽孢八叠球菌属、寡源杆菌属、动胶杆菌属、硫曲菌属、军团菌属、盐单胞菌属缺失(丰度为0),与非鳞癌组比较差异有统计学意义(P<0.05).结论 通过Illumina HiSep高通量测序技术建立本地区食管癌微生态基因集,鳞癌和非鳞癌食管菌群多样性无明显差异,但在门水平和属水平上存在明显差异.
作者:刘晓波;高子夜;徐文;屠新华;姜东升;王茂生;吴婷;周梦;李胜保;童强
来源:中华实用诊断与治疗杂志 2020 年 34卷 7期