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目的:利用生物信息学分析方法挖掘反复胚胎种植失败患者相关关键基因及通路,探讨其对子宫内膜容受性的影响。方法:从GEO数据库中下载GSE26787数据集及GSE111974数据集为研究样本,以重复植入失败的患者及既往正常妊娠的女性的子宫内膜组织数据为研究对象,使用R语言将原始数据经过质量分析、归一化、探针和基因名转换,构建表达矩阵后,利用limma包进行差异基因的筛选,进而利用DAVID数据库进行GO及KEGG分析,再使用String数据库及Cytoscape软件筛选关键基因。结果:得到两数据集共同关键基因 PTGS2、 PLCB1、 MGP、 CYP3A5、 LPAR3、 VCAM1、 ALPL、 SLC1A1、 SLC4A7、 SULT1E1及关键通路hsa01100。 结论:本研究所得的关键基因及通路可通过调控子宫内膜氧化还原及代谢状态进而影响子宫内膜容受性,可作为研究其相关作用的靶点。

作者:欧宇阳;赵颖

来源:中华生殖与避孕杂志 2022 年 42卷 7期

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作者:
欧宇阳;赵颖
来源:
中华生殖与避孕杂志 2022 年 42卷 7期
标签:
胚胎移植 子宫内膜容受性 氧化还原 代谢途径 Embryo transfer Endometrial receptivity Oxidation-reduction Metabolic pathways
目的:利用生物信息学分析方法挖掘反复胚胎种植失败患者相关关键基因及通路,探讨其对子宫内膜容受性的影响。方法:从GEO数据库中下载GSE26787数据集及GSE111974数据集为研究样本,以重复植入失败的患者及既往正常妊娠的女性的子宫内膜组织数据为研究对象,使用R语言将原始数据经过质量分析、归一化、探针和基因名转换,构建表达矩阵后,利用limma包进行差异基因的筛选,进而利用DAVID数据库进行GO及KEGG分析,再使用String数据库及Cytoscape软件筛选关键基因。结果:得到两数据集共同关键基因 PTGS2、 PLCB1、 MGP、 CYP3A5、 LPAR3、 VCAM1、 ALPL、 SLC1A1、 SLC4A7、 SULT1E1及关键通路hsa01100。 结论:本研究所得的关键基因及通路可通过调控子宫内膜氧化还原及代谢状态进而影响子宫内膜容受性,可作为研究其相关作用的靶点。