本研究运用网络药理学和分子对接的分析方法,探究杜仲防治骨质疏松的分子作用机制.通过TCMSP、GeneCards、OMIM以及DrugBank数据库分别对杜仲的入血有效活性成分、作用靶点以及与骨质疏松有关的疾病靶点进行汇总与筛选.将杜仲的有效活性成分与作用靶点经Cytoscape处理建立起药物-靶点的网络关系图,找到药物-疾病的共同作用靶点;通过STRING平台建立这些靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI),使用Network Analysis工具分析得到关键靶点;利用R语言进行关键靶点的基因本体(Gene Ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,并将分析数据可视化,最后利用AutoDock进行分子对接验证.结果显示筛选后共得到25个杜仲的有效活性成分和202个预测作用靶点,对应的主要化学成分为槲皮素、山柰酚和β-谷甾醇,与骨质疏松有关的疾病靶点共计4603个,与杜仲有共计144个共同作用靶点,在这144个关键靶点的PPI网络中筛选后得到14个关键靶点.关键靶点的基因富集结果显示,PTGS2、HSP90AA1、PPARG、ESR1和JUN等核心靶点主要通过影响细胞增殖以及各类应激反应等生物进程来防治骨质疏松,这些基因大多数集中出现在IL-17、TNF以及雌激素
作者：曲永嘉；孙晓伟；周国兴；程远志；戴鸿哲；李洪涛
来源：特产研究 2023 年 45卷 1期
