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目的:通过对欧洲裔美国人群腰臀比性状进行全基因组通路关联分析研究,以期寻找与腰臀比性状相关的信号通路.方法:以700例腹型肥胖患者(病例组)和358例正常人群(对照组)为研究对象,利用改良的基因富集分析法(GenGen软件)在全基因组大约550 000个SNP位点,1 347条通路/基因集合中对腰臀比性状进行全基因组通路关联分析.结果:腰臀比二分类变量(病例/对照)分析结果显示,65条通路/基因集合达到显著水平(empirical P<0.05),其中rasPathway (empirical P=0.003,FDR =0.238)最为显著,该通路相关基因也包含于ceramidePathway (empirical P=0.004,FDR =0.196)和hcmvPathway(empiricalP=0.005,FDR=0.203)信号通路中.结论:Ras信号通路可能与欧洲裔中美国人群的腰臀比性状相关.

作者:张苗苗;Struan Grant;Hakon Hakonarson;R.Arlen Price;张愿;李卫东;焦红肖

来源:天津医科大学学报 2018 年 24卷 2期

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作者:
张苗苗;Struan Grant;Hakon Hakonarson;R.Arlen Price;张愿;李卫东;焦红肖
来源:
天津医科大学学报 2018 年 24卷 2期
标签:
腰臀比 全基因组关联分析 通路关联分析 腹型肥胖 欧洲裔
目的:通过对欧洲裔美国人群腰臀比性状进行全基因组通路关联分析研究,以期寻找与腰臀比性状相关的信号通路.方法:以700例腹型肥胖患者(病例组)和358例正常人群(对照组)为研究对象,利用改良的基因富集分析法(GenGen软件)在全基因组大约550 000个SNP位点,1 347条通路/基因集合中对腰臀比性状进行全基因组通路关联分析.结果:腰臀比二分类变量(病例/对照)分析结果显示,65条通路/基因集合达到显著水平(empirical P<0.05),其中rasPathway (empirical P=0.003,FDR =0.238)最为显著,该通路相关基因也包含于ceramidePathway (empirical P=0.004,FDR =0.196)和hcmvPathway(empiricalP=0.005,FDR=0.203)信号通路中.结论:Ras信号通路可能与欧洲裔中美国人群的腰臀比性状相关.