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目的 基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(FAT2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析FAT2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值.方法 应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析FAT2变异与卵巢癌患者生存之间的关系.应用genecards数据库收集与FAT2基因相关的蛋白,绘制FAT2相关蛋白网络图,对相关蛋白进行富集分析,分析蛋白富集的信号通路、生理过程及关键下游基因.结果 311例卵巢癌样本中有12例发生FAT2基因变异,变异率为4

作者:翟惠惠;赵洪波;张琴;杨丽华

来源:天津医药 2017 年 45卷 12期

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作者:
翟惠惠;赵洪波;张琴;杨丽华
来源:
天津医药 2017 年 45卷 12期
标签:
卵巢肿瘤 上皮性卵巢癌 FAT2 Wnt信号通路 cbioprotal genecards ovarian neoplasms ovarian epithelail cancer FAT2 Wnt signaling pathway cbioprotal genecards
目的 基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(FAT2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析FAT2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值.方法 应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析FAT2变异与卵巢癌患者生存之间的关系.应用genecards数据库收集与FAT2基因相关的蛋白,绘制FAT2相关蛋白网络图,对相关蛋白进行富集分析,分析蛋白富集的信号通路、生理过程及关键下游基因.结果 311例卵巢癌样本中有12例发生FAT2基因变异,变异率为4