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背景:病变组织差异表达基因的分析有助于寻找与疾病发生、发展和临床治疗有关的关键分子.目的:应用寡核苷酸芯片对Barrett食管与正常食管黏膜组织的差异表达基因进行高通量分析,以期筛选与Barrett食管发生、发展相关的分子标记物.方法:取6例Barrett食管患者病变食管黏膜和相应正常食管黏膜组织,Trizol一步法抽提总RNA,纯化后合成cRNA探针:探针荧光标记和纯化后.将两种组织探针分别与Agilent全基因组寡核苷酸芯片(含30 968个基因组探针)进行杂交;获取芯片扫描图谱,以特征提取软件行定量分析、处理.结果:Barrett食管与正常食管黏膜组织的2倍差异表达(Ratio值≥2或≤0.5)基因中,上调基因142个,下调基因284个,涉及细胞周期相关基因、信号转导相关基因、黏蛋白相关基因、癌基因和抑癌基因、骨形态蛋白基因、凋亡抑制基因、bcl-2家族相关基凶等.结论:高通量的基因芯片技术可筛选出大量Barrett食管相关基因,对这些相关基因的功能进行验证将有助于找到Barrett食管发生、发展的关键基因或通路.

作者:汪兴伟;房殿春;郜恒骏;徐梅;徐江涛;杨仕明;孙永刚

来源:胃肠病学 2008 年 13卷 10期

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作者:
汪兴伟;房殿春;郜恒骏;徐梅;徐江涛;杨仕明;孙永刚
来源:
胃肠病学 2008 年 13卷 10期
标签:
Barrett食管 微阵列分析 差异表达 基因表达谱
背景:病变组织差异表达基因的分析有助于寻找与疾病发生、发展和临床治疗有关的关键分子.目的:应用寡核苷酸芯片对Barrett食管与正常食管黏膜组织的差异表达基因进行高通量分析,以期筛选与Barrett食管发生、发展相关的分子标记物.方法:取6例Barrett食管患者病变食管黏膜和相应正常食管黏膜组织,Trizol一步法抽提总RNA,纯化后合成cRNA探针:探针荧光标记和纯化后.将两种组织探针分别与Agilent全基因组寡核苷酸芯片(含30 968个基因组探针)进行杂交;获取芯片扫描图谱,以特征提取软件行定量分析、处理.结果:Barrett食管与正常食管黏膜组织的2倍差异表达(Ratio值≥2或≤0.5)基因中,上调基因142个,下调基因284个,涉及细胞周期相关基因、信号转导相关基因、黏蛋白相关基因、癌基因和抑癌基因、骨形态蛋白基因、凋亡抑制基因、bcl-2家族相关基凶等.结论:高通量的基因芯片技术可筛选出大量Barrett食管相关基因,对这些相关基因的功能进行验证将有助于找到Barrett食管发生、发展的关键基因或通路.