目的 采用生物信息学方法对肝癌差异表达基因进行基因功能和信号通路分析,为临床筛选肝癌发生、发展的相关分子标志物及药物靶点提供理论基础.方法 从公共数据库(GEO)中获取18例肝癌组织和18例癌旁组织的基因表达阵列数据进行生物信息学分析,筛选差异表达基因.利用DAVID和STRING数据库对差异表达基因进行基因功能、信号通路和蛋白相互作用分析.结果 通过对两组数据的差异表达基因筛选,共获得1 108个差异表达基因,其中上调基因605个、下调基因503个.差异表达基因主要涉及细胞周期、DNA复制、癌通路、p53信号通路、黏附、补体途径、三大营养物质代谢及性激素代谢等.通过STRING数据库分析列出位于前20位蛋白互作网络的中心节点蛋白.结论 本研究采用生物信息学方法对肝癌基因芯片数据进行挖掘,从基因水平探讨肝癌发生发展的物质基础、分子功能和生物学过程,为肝癌发生的机制研究、肿瘤标志物的筛选及药物靶点选择提供参考.
作者：彭莉；王天骄
来源：胃肠病学和肝病学杂志 2017 年 26卷 4期
