[目的]为了解新疆断裂带含硫冷泉泉水中细菌群落结构的组成和物种多样性.[方法]采用免培养法直接从冷泉水中提取环境总DNA,采用细菌通用引物对泉水中细菌的16S rRNA基因进行PCR扩增,构建16S rRNA基因克隆文库.使用限制性内切酶Hae Ⅲ对随机挑选的阳性克隆子进行限制性片段长度多态性分析(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP),选出具有不同酶切图谱的序列进行测序、BLAST比对和构建16S rRNA基因系统发育树.[结果]共从细菌16S rRNA基因文库中筛选了228个阳性克隆,RFLP分型得到33个不同的操作分类单元(Operational Taxonomic Unites,OTUs),覆盖度(Coverage C)为92
作者:李慧;曾军;高小其;杨红梅;张涛;杨晓芳;孙建;娄恺
来源:微生物学报 2011 年 51卷 5期