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[目的]通过分析NaC1胁迫下哈茨木霉(Trichoderma harzianum) ACCC32524转录组和代谢组数据,研究差异表达基因及次级代谢产物的变化情况,初步探索响应NaC1胁迫的分子机制.[方法]利用Illumina HiSeq XTen高通量测序平台完成O、0.4、0.6 mol/L NaC1浓度胁迫培养下哈茨木霉ACCC32524的转录组测序,GC-TOF-MS技术完成对0 mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫培养下的差异次级代谢产物检测,利用相关软件及数据库对差异表达基因(DEGs)和次级代谢产物的注释、筛选和分类,并进行RT-qPCR验证.[结果]本研究分别得到0.4 mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫下417和733条差异表达基因;GO富集分析显示,分别有318和582条差异表达基因注释到生物学过程、分子功能和细胞组分3个一级分类和40个二级分类;COG分类结果表明分别有232和414条转录本为20个类别,涉及差异表达基因最多的分别为氨基酸的转运和代谢、一般功能预测、碳水化合物的转运和代谢;KEGG代谢途径分析结果表明,分别有75和96条基因归到25个代谢通路中(P≤0.05),其中涉及差异基因最多的是氨基酸的生物合成和2-氧代羧酸代谢通路.从转录组数据中共筛选出与渗透调节、离子转运、活性氧清除等22个耐盐相关基因.O mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫下的代谢组数据中共筛选出101个差异次级代谢产物

作者:向杰;陈敬师;夏鑫鑫;刘快;李世贵;顾金刚

来源:微生物学报 2019 年 59卷 11期

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作者:
向杰;陈敬师;夏鑫鑫;刘快;李世贵;顾金刚
来源:
微生物学报 2019 年 59卷 11期
标签:
哈茨木霉 NaCl 转录组 代谢组 耐盐机理
[目的]通过分析NaC1胁迫下哈茨木霉(Trichoderma harzianum) ACCC32524转录组和代谢组数据,研究差异表达基因及次级代谢产物的变化情况,初步探索响应NaC1胁迫的分子机制.[方法]利用Illumina HiSeq XTen高通量测序平台完成O、0.4、0.6 mol/L NaC1浓度胁迫培养下哈茨木霉ACCC32524的转录组测序,GC-TOF-MS技术完成对0 mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫培养下的差异次级代谢产物检测,利用相关软件及数据库对差异表达基因(DEGs)和次级代谢产物的注释、筛选和分类,并进行RT-qPCR验证.[结果]本研究分别得到0.4 mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫下417和733条差异表达基因;GO富集分析显示,分别有318和582条差异表达基因注释到生物学过程、分子功能和细胞组分3个一级分类和40个二级分类;COG分类结果表明分别有232和414条转录本为20个类别,涉及差异表达基因最多的分别为氨基酸的转运和代谢、一般功能预测、碳水化合物的转运和代谢;KEGG代谢途径分析结果表明,分别有75和96条基因归到25个代谢通路中(P≤0.05),其中涉及差异基因最多的是氨基酸的生物合成和2-氧代羧酸代谢通路.从转录组数据中共筛选出与渗透调节、离子转运、活性氧清除等22个耐盐相关基因.O mol/L和0.6 mol/L NaC1胁迫下的代谢组数据中共筛选出101个差异次级代谢产物