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[背景]自2014年以来,H5N6禽流感病毒在我国家禽和活禽市场持续进化,成为人类和动物健康的重大威胁.[目的]对2017-2019年中国南方地区93株高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因进行分子进化分析.[方法]接种9-11日龄鸡胚分离核酸检测阳性的H5N6标本,运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,利用BLAST、MEGA 6.1及ClustalX等软件进行序列分析.[结果]2017-2019年,从189份江苏省H5亚型禽类/环境标本和1名H5N6患者咽拭子标本中共分离到43株病毒,完成了33株H5N6病毒的全基因组测序.下载网上同时期中国其他地区流行的H5N6毒株序列,对总计93株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析.93株H5N6病毒中有78株属于Clade2.3.4.4h,9株病毒属于Clade 2.3.4.4e,4株H5N6病毒属于Clade 2.3.4.4b,1 株属于Clade 2.3.4.4f,1 株属于Clade 2.3.4.4g.所有93株病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸,表明它们都属于高致病性禽流感病毒.所有93株病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸没有发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAa2-3Gal)结合特性;158位点丧失糖基化,同时124位出现一个新的潜在糖基化位点.[结论]2017-2019年间中国南方地区H5N6病毒进化活跃,具有明显的基因多样性,需要加强对病毒

作者:邓斐;祁贤;余慧燕;王慎骄;黄昊頔;许可;鲍倡俊

来源:微生物学通报 2021 年 48卷 2期

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作者:
邓斐;祁贤;余慧燕;王慎骄;黄昊頔;许可;鲍倡俊
来源:
微生物学通报 2021 年 48卷 2期
标签:
禽流感病毒 H5N6亚型 血凝素 分子进化
[背景]自2014年以来,H5N6禽流感病毒在我国家禽和活禽市场持续进化,成为人类和动物健康的重大威胁.[目的]对2017-2019年中国南方地区93株高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因进行分子进化分析.[方法]接种9-11日龄鸡胚分离核酸检测阳性的H5N6标本,运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,利用BLAST、MEGA 6.1及ClustalX等软件进行序列分析.[结果]2017-2019年,从189份江苏省H5亚型禽类/环境标本和1名H5N6患者咽拭子标本中共分离到43株病毒,完成了33株H5N6病毒的全基因组测序.下载网上同时期中国其他地区流行的H5N6毒株序列,对总计93株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析.93株H5N6病毒中有78株属于Clade2.3.4.4h,9株病毒属于Clade 2.3.4.4e,4株H5N6病毒属于Clade 2.3.4.4b,1 株属于Clade 2.3.4.4f,1 株属于Clade 2.3.4.4g.所有93株病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸,表明它们都属于高致病性禽流感病毒.所有93株病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸没有发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAa2-3Gal)结合特性;158位点丧失糖基化,同时124位出现一个新的潜在糖基化位点.[结论]2017-2019年间中国南方地区H5N6病毒进化活跃,具有明显的基因多样性,需要加强对病毒