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为对比16S rRNA和rpoB基因分子系统发育分析与传统表型分类法对铜绿假单胞菌的鉴定,评估16S rRNA和rpoB基因序列分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用,用表型分类方法对临床自动微生物鉴定系统鉴定为铜绿假单胞菌的23株分离株进行再鉴定,PCR扩增23株分离株16S rRNA和rpoB基因片段,并测序进行系统发育分析.结果表明,表型再鉴定结果与自动微生物鉴定系统鉴定结果一致.基于两个基因的系统发育分析均显示分离株p22与不动杆菌属序列聚为一枝,其余22株分离株与铜绿假单胞菌序列聚为一枝.因此p22应鉴定为不动杆菌,16S rRNA和rpoB基因序列分析均能准确鉴定铜绿假单胞菌并能较好建立假单胞菌属内种间关系.

作者:何艳霞;向诗非;李浇;何金蕾;张俊荣;袁冬梅;秦翰霄;陈达丽;陈建平

来源:微生物学杂志 2016 年 36卷 4期

知识库介绍

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作者:
何艳霞;向诗非;李浇;何金蕾;张俊荣;袁冬梅;秦翰霄;陈达丽;陈建平
来源:
微生物学杂志 2016 年 36卷 4期
标签:
铜绿假单胞菌 16S rRNA rpoB Pseudomonas aeruginosa 16S rRNA rpoB
为对比16S rRNA和rpoB基因分子系统发育分析与传统表型分类法对铜绿假单胞菌的鉴定,评估16S rRNA和rpoB基因序列分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用,用表型分类方法对临床自动微生物鉴定系统鉴定为铜绿假单胞菌的23株分离株进行再鉴定,PCR扩增23株分离株16S rRNA和rpoB基因片段,并测序进行系统发育分析.结果表明,表型再鉴定结果与自动微生物鉴定系统鉴定结果一致.基于两个基因的系统发育分析均显示分离株p22与不动杆菌属序列聚为一枝,其余22株分离株与铜绿假单胞菌序列聚为一枝.因此p22应鉴定为不动杆菌,16S rRNA和rpoB基因序列分析均能准确鉴定铜绿假单胞菌并能较好建立假单胞菌属内种间关系.