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目的:为深入研究 miR-199a-3p 在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析 miR-199a-3p 序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析;构建 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果miR-199a-3p 序列在多物种间具有高度保守性;GO 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P <0.01);KEGG Pathway 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM 受体的相互作用通路、PI3K-Akt 信号通路、MAPK 信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等;根据构建的 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受 miR-199a-3p 调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论miR-199a-3p 可能通过直接靶向作用 mTOR,调节 PI3K-Akt-mTOR 信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。

作者:谢小娟;潘晶晶;魏力强;陈葳

来源:西安交通大学学报(医学版) 2016 年 2期

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作者:
谢小娟;潘晶晶;魏力强;陈葳
来源:
西安交通大学学报(医学版) 2016 年 2期
标签:
miR-1 99a-3p 生物信息学 mTOR GO 富集分析 KEGG Pathway 分析 膀胱癌 PI3K-Akt MAPK 蛋白聚糖 miR-1 99a-3p bioinformatics mammalian target of rapamycin (mTOR) gene ontology (GO) enrichment analysis Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome (KEGG)pathway analysis bladder cancer PI3K-Akt MAPK proteoglycan
目的:为深入研究 miR-199a-3p 在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析 miR-199a-3p 序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析;构建 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果miR-199a-3p 序列在多物种间具有高度保守性;GO 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P <0.01);KEGG Pathway 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM 受体的相互作用通路、PI3K-Akt 信号通路、MAPK 信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等;根据构建的 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受 miR-199a-3p 调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论miR-199a-3p 可能通过直接靶向作用 mTOR,调节 PI3K-Akt-mTOR 信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。