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目的:探索有氧运动对代谢综合征患者血液基因表达的影响,分析运动前后血液转录表达谱的差异,研究差异表达基因涉及的功能与内在联系.方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片数据平台(GEO)下载GSE10 5 40数据集mRNA芯片数据,对5 名代谢综合征患者运动前后的mRNA表达谱数据进行基因集富集分析(GSEA),应用metascape软件进行功能富集(GO)和信号通路(KEGG)富集分析,用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络.结果:运动后血样比较运动前共筛选出152 个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中有54 个基因上调,98 个显著下调.GESA分析发现12 个基因或通路在运动后表达谱中显著富集负相关,蛋白质相互作用网络筛选出9 个关键蛋白.结论:代谢综合征患者运动前后血样相关DEGs揭示了代谢综合征的分子特征,这些基因可能与癌症发生之间呈负相关,这为进一步探讨有氧运动对代谢综合征患者健康改善的作用机制及关键调控分子提供了研究思路.

作者:宋雷;蒋文杰

来源:西北民族大学学报(自然科学版) 2023 年 44卷 3期

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作者:
宋雷;蒋文杰
来源:
西北民族大学学报(自然科学版) 2023 年 44卷 3期
标签:
生物信息学 有氧运动 代谢综合征 蛋白质相互作用网络 Bioinformatics Aerobic exercise Metabolic syndrome Protein interaction networks
目的:探索有氧运动对代谢综合征患者血液基因表达的影响,分析运动前后血液转录表达谱的差异,研究差异表达基因涉及的功能与内在联系.方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片数据平台(GEO)下载GSE10 5 40数据集mRNA芯片数据,对5 名代谢综合征患者运动前后的mRNA表达谱数据进行基因集富集分析(GSEA),应用metascape软件进行功能富集(GO)和信号通路(KEGG)富集分析,用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络.结果:运动后血样比较运动前共筛选出152 个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中有54 个基因上调,98 个显著下调.GESA分析发现12 个基因或通路在运动后表达谱中显著富集负相关,蛋白质相互作用网络筛选出9 个关键蛋白.结论:代谢综合征患者运动前后血样相关DEGs揭示了代谢综合征的分子特征,这些基因可能与癌症发生之间呈负相关,这为进一步探讨有氧运动对代谢综合征患者健康改善的作用机制及关键调控分子提供了研究思路.