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目的 基于网络药理学、分子对接技术探究三七干预肝癌的潜在作用靶点及机制.方法 采用网络药理学的方法,通过TCMSP、CNKI、PubMed筛选三七的活性成分;通过GeneCard、SwissTarget Prediction获取三七活性成分的作用靶标;采用Cytoscape软件对三七干预肝癌的成分与靶点进行可视化,得到药物-成分-靶点网络图,通过STRING网站构建蛋白相互作用(PPI)网络,再用R软件对三七干预肝癌的靶点基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后采用分子对接技术对所得结果进行验证.结果 根据生物利用度和类药性从三七成分中共筛选出 7个有效成分和253 个靶基因,GeneCards中得到与肝癌相关靶基因16 964 个,二者取交集得到161 个三七干预肝癌有效靶点.经GO功能富集分析发现的基因与细胞因子活性、转录因子活性、核受体活性等功能有关,且经KEGG通路富集分析发现其与肿瘤、乙型肝炎、脂质和动脉粥样硬化等通路有关.分子对接结果发现,PPI网络中排名前 3 位的活性成分与排名前3 位的核心靶点蛋白可自发结合,且具有较强的结合活性.结论 三七防治肝癌的核心靶点为AKT1、白细胞介素-6 等,其机制可能与MAPK信号通路、AKT信号通路等有关.

作者:杨宝乐;王小娟;张书瑜;马川;李进虎;黄琼

来源:转化医学杂志 2023 年 12卷 4期

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作者:
杨宝乐;王小娟;张书瑜;马川;李进虎;黄琼
来源:
转化医学杂志 2023 年 12卷 4期
标签:
三七 肝癌 网络药理学 分子对接 蛋白相互作用 GO功能富集 KEGG通路富集 MAPK信号通路 Panax Notoginseng Hepatocellular carcinoma Network pharmacology Molecular docking Protein-protein interaction networks GO functional enrichment KEGG pathway enrichment MAPK signaling pathway
目的 基于网络药理学、分子对接技术探究三七干预肝癌的潜在作用靶点及机制.方法 采用网络药理学的方法,通过TCMSP、CNKI、PubMed筛选三七的活性成分;通过GeneCard、SwissTarget Prediction获取三七活性成分的作用靶标;采用Cytoscape软件对三七干预肝癌的成分与靶点进行可视化,得到药物-成分-靶点网络图,通过STRING网站构建蛋白相互作用(PPI)网络,再用R软件对三七干预肝癌的靶点基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后采用分子对接技术对所得结果进行验证.结果 根据生物利用度和类药性从三七成分中共筛选出 7个有效成分和253 个靶基因,GeneCards中得到与肝癌相关靶基因16 964 个,二者取交集得到161 个三七干预肝癌有效靶点.经GO功能富集分析发现的基因与细胞因子活性、转录因子活性、核受体活性等功能有关,且经KEGG通路富集分析发现其与肿瘤、乙型肝炎、脂质和动脉粥样硬化等通路有关.分子对接结果发现,PPI网络中排名前 3 位的活性成分与排名前3 位的核心靶点蛋白可自发结合,且具有较强的结合活性.结论 三七防治肝癌的核心靶点为AKT1、白细胞介素-6 等,其机制可能与MAPK信号通路、AKT信号通路等有关.