目的 探讨前列腺癌(PCa)组织中免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)临床意义,为治疗PCa提供参考.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载PCa转录数据与临床数据,获取PCa中lncRNA;再下载与免疫相关的基因集;对获取的免疫基因与lncRNA采用Pearson相关性分析法进行共表达以确定与免疫相关的lncRNA,再通过单因素Cox回归和Lasso回归确定关键的lncRNA;采用R软件中的“ggplot package”和“survival package”分析这些lncRNA与临床特征的相关性与预后价值.我们使用lnc2RNA数据库分析lncRNA在正常前列腺组织与PCa组织之间的表达差异.最后使用Starbase、David在线网站确定有预后价值的lncRNA的靶基因和靶基因的富集分析.结果 AL162586.1、AC138028.4、SLC25A25-AS1、AC002553.1、AC004816.1、LINC00641、AC027796.4是免疫相关且关键的lncRNA,其表达量随着N等级的升高而升高;AL162586.1和SLC25A25-AS1表达量随着T等级升高而升高.SLC25A25-AS1和HNC00641在肿瘤组织中和正常组织中表达量有差异.基因本体论(GO)富集结果显示SLC25A25-AS1主要分布于细胞膜、通过剪接体对mRNA剪接进行负调控,并与核苷酸结合;在KEGG富集中主要富集在剪接体通路.结论 lncRNA已成为PCa新的研究方向,其中SLC25A25-AS1可能是通过剪接途径影响PCa
作者:王一鹤;王焱;底斐瑶;底泽亚;席镤;文一博;冶卓;任川川;文建国
来源:细胞与分子免疫学杂志 2021 年 37卷 2期