目的 分析熊去氧胆酸(UDCA)治疗应答不佳的差异表达基因,为原发性胆汁性胆管炎(PBC)的治疗提供理论依据.方法 通过检索基因表达数据集(GEO)数据库获得UDCA应答相关基因芯片数据集,筛选差异表达基因(DEG),构建蛋白相互作用网络图,利用注释、可视化和集成发现数据库DAVID进行生物学功能和信号通路的富集分析,并利用反卷积算法CIBERSORT软件对22种免疫细胞的浸润情况进行分析,最后利用关键基因与医学本体信息检索平台Coremine对既与UDCA应答相关,又与免疫细胞浸润相关的DEG进行中药预测.结果 通过分析UDCA应答组与UDCA应答不佳组基因的表达,获得99个DEG.生物学功能和信号通路富集分析提示上调的DEG主要富集于免疫反应、病毒感染、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路等,下调的DEG主要富集于免疫反应、炎症反应、补体级联反应、病毒感染、系统性红斑狼疮等.免疫细胞浸润分析结果表明初始B细胞、未活化的CD4+T记忆细胞、M1巨噬细胞、未活化的树突状细胞等占主要比例,其中在UDCA应答不佳组肝脏组织中γδT细胞浸润水平较UDCA应答组中显著降低.Coremine中药预测结果显示当归、黄芩、土木香、丹参、厚朴花五味中药与UDCA反应性和免疫细胞浸润的关系最密切.结论 筛选出可能与UDCA应答相关的多种DEG.免疫
作者：李麟；宋翊；陈新瑜；黄祎；刘华宝
来源：细胞与分子免疫学杂志 2022 年 38卷 1期
