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该研究基于茶树的转录组数据,采用RT‐PCR方法从茶树‘黄金芽’cDNA中克隆获得茶树谷丙转氨酶基因(CsA laA T),利用荧光定量PCR方法,对 CsA laA T在茶树材料‘迎霜’和‘黄金芽’不同组织、温度胁迫与激素处理的表达进行分析。结果显示:CsA laA T基因开放阅读框长度为1662 bp ,编码553个氨基酸,含有天冬氨酸转氨酶家族(Aspartate aminotransferase family )典型的AAT‐like保守结构域。多序列比对显示,该序列与多个相关物种的序列一致性达78.83%,与磷酸吡哆醛(PL P )结合的10个氨基酸残基以及第358位赖氨酸催化位点在物种间高度保守。茶树CsAlaAT蛋白属亲水性蛋白,相对分子质量为60877.5 D ,等电点为6.11,碱性、酸性、脂肪族和芳香族氨基酸比例分别为12%、11%、22%和8%,无序化特征不明显,与大麦 HvAlaAT具有相似的三维结构。实时定量PCR分析表明,CsA laA T在茶树‘迎霜’和‘黄金芽’中的表达均具有组织特异性,且均在根部的表达量最高;CsA laA T响应高温(38℃)和低温(4℃)胁迫的表达上调;外源施用脱落酸(ABA )和赤霉素(GA )能够抑制茶树中CsA laA T基因的表达。

作者:崔新;刘志薇;吴致君;李辉;王文丽;庄静

来源:西北植物学报 2016 年 36卷 12期

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作者:
崔新;刘志薇;吴致君;李辉;王文丽;庄静
来源:
西北植物学报 2016 年 36卷 12期
标签:
茶树 谷丙转氨酶 多序列比对 温度胁迫 激素 表达分析 Camellia sinensis alanine aminotransferase multiple alignment temperature stress hor-mone expression profiles
该研究基于茶树的转录组数据,采用RT‐PCR方法从茶树‘黄金芽’cDNA中克隆获得茶树谷丙转氨酶基因(CsA laA T),利用荧光定量PCR方法,对 CsA laA T在茶树材料‘迎霜’和‘黄金芽’不同组织、温度胁迫与激素处理的表达进行分析。结果显示:CsA laA T基因开放阅读框长度为1662 bp ,编码553个氨基酸,含有天冬氨酸转氨酶家族(Aspartate aminotransferase family )典型的AAT‐like保守结构域。多序列比对显示,该序列与多个相关物种的序列一致性达78.83%,与磷酸吡哆醛(PL P )结合的10个氨基酸残基以及第358位赖氨酸催化位点在物种间高度保守。茶树CsAlaAT蛋白属亲水性蛋白,相对分子质量为60877.5 D ,等电点为6.11,碱性、酸性、脂肪族和芳香族氨基酸比例分别为12%、11%、22%和8%,无序化特征不明显,与大麦 HvAlaAT具有相似的三维结构。实时定量PCR分析表明,CsA laA T在茶树‘迎霜’和‘黄金芽’中的表达均具有组织特异性,且均在根部的表达量最高;CsA laA T响应高温(38℃)和低温(4℃)胁迫的表达上调;外源施用脱落酸(ABA )和赤霉素(GA )能够抑制茶树中CsA laA T基因的表达。