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目的 通过数据库挖掘藤梨根治疗胃癌的作用机制.方法 通过TCMSP数据库筛选药物活性成分及作用靶点,结合Gene Cards、OMIM、PharmGKB、DrugBank以及TTD数据库中的胃癌相关靶点,构建"药物-化合物-交集靶点"网络,并对交集靶点进行蛋白网络互作(PPI)运算及功能分析以进一步得出藤梨根治疗胃癌的核心基因.最后使用Autodock软件对藤梨根活性成分及核心基因进行分子对接.结果 经分析发现,藤梨根有效化合物共6个,对应靶点468个;胃癌靶点12117个,与藤梨根中5个化合物取得交集靶点共148个,其中核心基因13个.GO功能分析结果示,生物过程涉及细胞对化学应激的反应、金属离子响应、脂多糖反应等,KEGG富集分析主要涉及PI3K-AKT信号通路、炎症相关信号通路(TNF、IL17A)、肿瘤相关信号通路等.分子对接结果显示藤梨根其主要活性成分与核心靶点结合能均<-5 kcal/mol,能够自发结合,其中具有较强结合活性(结合能≤-7 kcal/mol)成分靶点占82.8%以上.结论 藤梨根的活性成分可能主要通过调控PI3K-Akt、TNF等信号通路,作用于AKT1、MAPK1、ESR1等靶点,进而发挥对胃癌的抑制作用,并呈现出多成分、多靶点、多通路的特性.

作者:王维强;郝民琦;叶晓莹;罗敏;高卓维

来源:现代消化及介入诊疗 2023 年 28卷 1期

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作者:
王维强;郝民琦;叶晓莹;罗敏;高卓维
来源:
现代消化及介入诊疗 2023 年 28卷 1期
标签:
藤梨根 胃癌 网络药理学 分子对接 作用机制
目的 通过数据库挖掘藤梨根治疗胃癌的作用机制.方法 通过TCMSP数据库筛选药物活性成分及作用靶点,结合Gene Cards、OMIM、PharmGKB、DrugBank以及TTD数据库中的胃癌相关靶点,构建"药物-化合物-交集靶点"网络,并对交集靶点进行蛋白网络互作(PPI)运算及功能分析以进一步得出藤梨根治疗胃癌的核心基因.最后使用Autodock软件对藤梨根活性成分及核心基因进行分子对接.结果 经分析发现,藤梨根有效化合物共6个,对应靶点468个;胃癌靶点12117个,与藤梨根中5个化合物取得交集靶点共148个,其中核心基因13个.GO功能分析结果示,生物过程涉及细胞对化学应激的反应、金属离子响应、脂多糖反应等,KEGG富集分析主要涉及PI3K-AKT信号通路、炎症相关信号通路(TNF、IL17A)、肿瘤相关信号通路等.分子对接结果显示藤梨根其主要活性成分与核心靶点结合能均<-5 kcal/mol,能够自发结合,其中具有较强结合活性(结合能≤-7 kcal/mol)成分靶点占82.8%以上.结论 藤梨根的活性成分可能主要通过调控PI3K-Akt、TNF等信号通路,作用于AKT1、MAPK1、ESR1等靶点,进而发挥对胃癌的抑制作用,并呈现出多成分、多靶点、多通路的特性.