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目的 通过网络药理学和分子对接方法探讨大黄在胃癌中的抗肿瘤机制.方法 通过TCMSP网站收集大黄的活性成分及对应的靶点,利用肿瘤与癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库、GeneCards网站得到胃癌相关基因,两者取交集,利用Cytoscape软件绘制胃癌-大黄-活性成分-靶点的网络图.通过Metascape网站对交集靶点进行功能、同路富集分析以及蛋白-蛋白相互作用网络分析,利用MCODE算法确定关键基因簇,最后利用分子对接方法找到可能的作用靶点.结果 通过筛选得到大黄的主要活性成分16个,共获得46个治疗胃癌的潜在靶点,京都基因和基因组数据库 (KEGG) 通路、基因本体论 (GO) 分类富集分析结果显示,大黄治疗胃癌的机制涉及多个生物学过程,包括凋亡、程序性细胞死亡、MAPK通路调节、细胞周期、PI3K-Akt等信号通路.蛋白-蛋白互作后发现关键基因簇包括BCL2、CASP8、AR、IL1B、CASP3、PRKCA、TP53、CDKN1A、PCNA,主要为凋亡相关基因,进一步分子对接验证了其与对应活性成分之间亲合度均较高,其中PKCNA与芦荟大黄素亲合度最高.结论 大黄治疗胃癌通过多成分、多靶点、多通路协同起效,本研究为后续进一步研究提供了充分的理论依据.

作者:何欣;刘云鹏;李冬阳;车晓芳

来源:中国医科大学学报 2023 年 52卷 1期

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作者:
何欣;刘云鹏;李冬阳;车晓芳
来源:
中国医科大学学报 2023 年 52卷 1期
标签:
大黄 胃癌 网络药理学 作用机制 分子对接
目的 通过网络药理学和分子对接方法探讨大黄在胃癌中的抗肿瘤机制.方法 通过TCMSP网站收集大黄的活性成分及对应的靶点,利用肿瘤与癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库、GeneCards网站得到胃癌相关基因,两者取交集,利用Cytoscape软件绘制胃癌-大黄-活性成分-靶点的网络图.通过Metascape网站对交集靶点进行功能、同路富集分析以及蛋白-蛋白相互作用网络分析,利用MCODE算法确定关键基因簇,最后利用分子对接方法找到可能的作用靶点.结果 通过筛选得到大黄的主要活性成分16个,共获得46个治疗胃癌的潜在靶点,京都基因和基因组数据库 (KEGG) 通路、基因本体论 (GO) 分类富集分析结果显示,大黄治疗胃癌的机制涉及多个生物学过程,包括凋亡、程序性细胞死亡、MAPK通路调节、细胞周期、PI3K-Akt等信号通路.蛋白-蛋白互作后发现关键基因簇包括BCL2、CASP8、AR、IL1B、CASP3、PRKCA、TP53、CDKN1A、PCNA,主要为凋亡相关基因,进一步分子对接验证了其与对应活性成分之间亲合度均较高,其中PKCNA与芦荟大黄素亲合度最高.结论 大黄治疗胃癌通过多成分、多靶点、多通路协同起效,本研究为后续进一步研究提供了充分的理论依据.