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目的 了解2012年北京市朝阳区引起手足口病的非EV71、非CoxAl6型肠道病毒的病原构成及优势型别,为本地区手足口病的防控工作提供科学依据.方法 收集2012年手足口病患者咽拭子样本或粪便样本共815份.经Real-time PCR确定非EV71、非CoxAl6型肠道病毒阳性样本;PCR分别扩增病毒5'UTR区和VP2基因区片段,对PCR阳性扩增产物进行测序,经BLAST比对确定病毒型别;并对VP2基因序列进行聚类分析.结果 Real-time PCR确定了61例非EV71、非CoxA16型肠道病毒阳性样本.测序结果共确定CoxA10型44例(73.3%,44/60)、CoxA6型8例(13.3%,8/60)及CoxA4型1例(1.7%,1/60);有1例样本确定为EV71型;另有7例样本分型失败.聚类结果显示本地区的CoxA10型、CoxA6型和CoxA4型肠道病毒的VP2核苷酸序列与中国地区的毒株有较高同源性,而与其各自的原型株同源性相对较低;此外,本地区的CoxA6型肠道病毒存在两个传播链的共循环.结论 2012年北京市朝阳区引起手足口病的非EV71、非CoxAl6型肠道病毒型别多样,包括CoxA10、CoxA6和CoxA4型.CoxA10型为非EV71、非CoxAl6型肠道病毒中的优势型别.

作者:王海滨;雷娜;姜晓红;赵剑虹;王晶;宋衍燕;李书明

来源:现代预防医学 2014 年 41卷 9期

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作者:
王海滨;雷娜;姜晓红;赵剑虹;王晶;宋衍燕;李书明
来源:
现代预防医学 2014 年 41卷 9期
标签:
手足口病 肠道病毒 基因型 Hand, foot and mouth disease Enterovirus Genotype
目的 了解2012年北京市朝阳区引起手足口病的非EV71、非CoxAl6型肠道病毒的病原构成及优势型别,为本地区手足口病的防控工作提供科学依据.方法 收集2012年手足口病患者咽拭子样本或粪便样本共815份.经Real-time PCR确定非EV71、非CoxAl6型肠道病毒阳性样本;PCR分别扩增病毒5'UTR区和VP2基因区片段,对PCR阳性扩增产物进行测序,经BLAST比对确定病毒型别;并对VP2基因序列进行聚类分析.结果 Real-time PCR确定了61例非EV71、非CoxA16型肠道病毒阳性样本.测序结果共确定CoxA10型44例(73.3%,44/60)、CoxA6型8例(13.3%,8/60)及CoxA4型1例(1.7%,1/60);有1例样本确定为EV71型;另有7例样本分型失败.聚类结果显示本地区的CoxA10型、CoxA6型和CoxA4型肠道病毒的VP2核苷酸序列与中国地区的毒株有较高同源性,而与其各自的原型株同源性相对较低;此外,本地区的CoxA6型肠道病毒存在两个传播链的共循环.结论 2012年北京市朝阳区引起手足口病的非EV71、非CoxAl6型肠道病毒型别多样,包括CoxA10、CoxA6和CoxA4型.CoxA10型为非EV71、非CoxAl6型肠道病毒中的优势型别.