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目的 研究江西省近10年风疹病毒野毒株的基因特性,为江西省的风疹防控提供技术支撑.方法 采集江西省2006-2015年风疹疑似病例咽拭子标本,用Vero/SLAM细胞对标本进行病毒分离培养,再对细胞分离物进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对细胞分离物进行风疹病毒核酸鉴定,采用RT-PCR对风疹病毒核酸检测阳性标本扩增病毒糖蛋白E1基因,对其核苷酸序列进行测定,运用生物学软件对测定序列进行处理分析.结果 江西省2006-2015年风疹病毒野毒株分属于2个基因型:1E基因型(14株)和2B基因型(20株),1E基因型为江西省2005-2013年风疹病毒流行唯一基因型,并在2015年被2B基因型替代.1E和2B基因型各毒株之间E1基因核苷酸同源性分别为97.6%~ 99.9%和99.2%~ 99.9%,与疫苗株BRDII株核苷酸同源性分别为89.4%~ 89.9%和92.6%-93.0%,氨基酸同源性为98.8%~99.6%;氨基酸序列相对保守,未发现重要抗原位点的改变.结论 1E基因型和2B基因型为江西省2006-2015年风疹病毒流行的基因型,2B基因型为2015年首次在江西省发现,并为当年的绝对优势基因型.

作者:龚甜;熊英;张艳妮;施勇;周珺

来源:现代预防医学 2016 年 43卷 24期

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作者:
龚甜;熊英;张艳妮;施勇;周珺
来源:
现代预防医学 2016 年 43卷 24期
标签:
风疹病毒 基因特性 江西省 Rubella virus Genetic characteristics Jiangxi province
目的 研究江西省近10年风疹病毒野毒株的基因特性,为江西省的风疹防控提供技术支撑.方法 采集江西省2006-2015年风疹疑似病例咽拭子标本,用Vero/SLAM细胞对标本进行病毒分离培养,再对细胞分离物进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对细胞分离物进行风疹病毒核酸鉴定,采用RT-PCR对风疹病毒核酸检测阳性标本扩增病毒糖蛋白E1基因,对其核苷酸序列进行测定,运用生物学软件对测定序列进行处理分析.结果 江西省2006-2015年风疹病毒野毒株分属于2个基因型:1E基因型(14株)和2B基因型(20株),1E基因型为江西省2005-2013年风疹病毒流行唯一基因型,并在2015年被2B基因型替代.1E和2B基因型各毒株之间E1基因核苷酸同源性分别为97.6%~ 99.9%和99.2%~ 99.9%,与疫苗株BRDII株核苷酸同源性分别为89.4%~ 89.9%和92.6%-93.0%,氨基酸同源性为98.8%~99.6%;氨基酸序列相对保守,未发现重要抗原位点的改变.结论 1E基因型和2B基因型为江西省2006-2015年风疹病毒流行的基因型,2B基因型为2015年首次在江西省发现,并为当年的绝对优势基因型.