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目的 对2014-2015年银川市流行的风疹病毒进行分离鉴定,确定其基因型,并进行基因与氨基酸的特征分析.方法 采用Real-time PCR法对采集的疑似风疹病例的咽拭子标本进行初筛,阳性标本使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离,采用RT-PCR法对病毒培养物进行风疹病毒株E1基因的标准靶核苷酸序列扩增,并对扩增产物进行序列测定与分析.结果 2014-2015年银川市共分离到24株风疹病毒株,进化树结果显示均为2B基因型;24株分离株之间的核苷酸与氨基酸同源性分别为98.1%~100.0%和97.5%~ 100.0%.对核苷酸编码的氨基酸序列进行比对,尽管出现了多个氨基酸的突变位点,但关键位点如N-型糖基化位点、血凝抑制位点、中和位点以及重要的抗原表位均未发生变化.结论 2014-2015年银川市流行的风疹病毒主要是2B基因型,与国内其他地区普遍流行的基因型(1E基因型)不一致.虽然出现了氨基酸的变异,但关键位点的氨基酸序列高度保守,病毒抗原性较稳定.

作者:张伟宏;雷静;纳玮;马学旻;晋博烜;谭玉臻;张成;严建龙

来源:现代预防医学 2017 年 44卷 16期

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作者:
张伟宏;雷静;纳玮;马学旻;晋博烜;谭玉臻;张成;严建龙
来源:
现代预防医学 2017 年 44卷 16期
标签:
风疹病毒 基因型 遗传特征 Rubella virus Genotype Genetic characteristics
目的 对2014-2015年银川市流行的风疹病毒进行分离鉴定,确定其基因型,并进行基因与氨基酸的特征分析.方法 采用Real-time PCR法对采集的疑似风疹病例的咽拭子标本进行初筛,阳性标本使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离,采用RT-PCR法对病毒培养物进行风疹病毒株E1基因的标准靶核苷酸序列扩增,并对扩增产物进行序列测定与分析.结果 2014-2015年银川市共分离到24株风疹病毒株,进化树结果显示均为2B基因型;24株分离株之间的核苷酸与氨基酸同源性分别为98.1%~100.0%和97.5%~ 100.0%.对核苷酸编码的氨基酸序列进行比对,尽管出现了多个氨基酸的突变位点,但关键位点如N-型糖基化位点、血凝抑制位点、中和位点以及重要的抗原表位均未发生变化.结论 2014-2015年银川市流行的风疹病毒主要是2B基因型,与国内其他地区普遍流行的基因型(1E基因型)不一致.虽然出现了氨基酸的变异,但关键位点的氨基酸序列高度保守,病毒抗原性较稳定.